极端微生物植物的基因组测序
Thellungiella parvula是一种能够在恶劣条件和贫瘠资源的栖息地中生存的植物 - 极端微生物。来自美国,沙特阿拉伯和韩国的一组研究人员使用新一代DNA测序工具来组装该物种的基因组草图,以了解它如何进化出其强壮的性格。
研究人员将 T. parvula与 拟南芥(Arabidopsis thaliana)进行了比较,拟南芥是一种近似相似的基因组,具有类似大小的基因组,但对其有压力敏感性。他们在Nature Genetics上发表了他们的发现 。
这两种植物的遗传信息差异很大,主要是通过基因的串联重复。许多这些重复的基因负责编码在恶劣环境中T.plavula存活所必需的功能 。相比之下,拟南芥中存在的重复基因 适合潮湿,凉爽的环境。
这些重复基因的性质意味着它们可能在T. parvula的进化中起到了 耐受压力的作用。研究人员认为,详细检查基因组结构及其复杂基因,分析重复基因编码的酶,特别是与压力敏感植物相比,可以帮助我们了解T. parvula如何 在恶劣条件下繁衍生息。这可以帮助科学家在作物植物中建立应激防御,这种植物通常无法在压力环境中生长。
“植物的干旱和耐盐性已经研究了几十年,基因工程对一些基因的修饰几乎没有取得进展,”伊利诺伊大学厄巴纳 - 香槟分校的植物生物学家Maheshi Dassanayake说。该论文的作者。“通过 T. parvula基因组,我们更接近于了解自然界对干旱,盐度,寒冷和低营养土壤的解决方案,并使成功的策略适应我们的作物植物。”
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