NHGRI史密森尼序列可能是北美最古老的狗类遗物
十一万年前,古印第安人在科罗拉多州东北部的干草原上漫步,寻找数量逐渐减少的猛犸象和更丰富的野牛群。这些猎人使用了在他们的杀戮地点发现的矛头和箭尖 - 称为Folsom点。
1974年,史密森尼学会国家自然历史博物馆(NMNH)的考古学家,古印度/古生物学项目主任丹尼斯斯坦福博士对其中一个地点进行了全面挖掘,称为琼斯 - 在科罗拉多州尤马县的米勒地狱峡谷野牛杀戮地点。他们发现野牛遗骸和Folsom点,但该遗址还包含狗遗骸。考古学家们拯救了这一系列古老的影响,但直到几个月前,这些狗骨头仍未被触及。
然后,在2014年春天,斯坦福博士参加了NHGRI癌症遗传学和比较基因组学分会的高级研究员Elaine Ostrander博士的关于犬(狗)基因组学的讨论。Ostrander博士谈到了她对影响狗和人类疾病发展的基因的研究。她的演讲“狗基因组:人类疾病的曙光”是NHGRI-NMNH展览“ Genome:Unlocking Life's
斯坦福博士意识到NMNH收集古代狗骨头对犬基因组研究的潜在重要性,但直到最近,科学家还没有使用古代DNA或狗基因组完整序列所需的工具或技术。 (2005年出版)他们可以比较古代的狗DNA。
2014年8月,由于这种认识,Ostrander博士检查了古老的狗骨头。在同一次访问中,Klaus Koepfli博士 史密森尼保护生物学研究所,物种生存保护中心和Brennan Decker,MD / Ph.D. NIH-剑桥学者计划的候选人帮助钻取骨骼并提取小样本,这些样本后来可用于分离DNA。
Ostrander博士与加州大学洛杉矶分校(UCLA)生态与进化生物学系教授Robert Wayne博士长期合作,他是一位专攻古代DNA的实验室的负责人。 。他的实验室拥有进行易碎样品DNA提取所必需的无菌设施。Ostrander博士和她的团队将在韦恩博士的邀请下前往加州大学洛杉矶分校,从狗骨中分离DNA,为基因组测序做准备。
根据奥斯特兰德博士的说法,这些骨骼的形状非常好:牙齿附着在头骨上,趾甲仍然完好无损,多个连续的骨骼以正确的顺序存在,并且可以看到不同水平的骨骼结构。来自25至30个样本的DNA可以揭示狗与现今品种相比的样子。此外,DNA可以通过在时间和背景中放置早期驯养的狗来提供关于狗与当时人们互动的线索。
“如果遗体被发现像杀戮地点一样有11000岁,那么来自一只小狗的骨头将代表北美发现的最古老的狗文物,”奥斯特兰德博士说。
在接下来的六个月中,研究小组应该知道他们的尝试是否可以产生核DNA序列,或者至少是样品中的线粒体DNA序列。核DNA被包装到细胞核内的染色体中,并从父母双方遗传。线粒体DNA通过母体向下传递,代表人类基因组中估计的20,000至25,000个基因的一部分。
“核DNA的重要性不容小觑,”奥斯特兰德博士说。“它可以提供有关狗祖先的信息,当代狗和狼之间的相似性,以及狗驯化的时间,”奥斯特兰德博士说。
Ostrander博士的研究重点是研究生长调节中重要的基因,特别是它们对影响犬科动物和人类的疾病的影响。她的研究小组在基因组中搜索控制家犬形态身体计划的基因,家犬的品种表现出非同寻常的变异。他们的大部分研究都集中在使用犬基因组来理解和鉴定犬科动物和人类健康的基因。
“NHGRI和史密森学会之间的这种高影响力合作代表了合作研究如何看待的一个典型例子,”NHCES在政策,传播和教育部门的NHGRI教育和社区参与分部主任Vence Bonham说。
根据奥斯特兰德博士的说法,她和她的团队“非常兴奋地等待”这可能是一个有新闻价值的发现。她说,这项研究的未来发现可能会发表在学术期刊上。
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