研究人员对干枣的基因组进行序列分析
干枣品种'Junzao'的高质量基因组序列以及整个范围内树木的序列,已经阐明了这种流行的亚洲果树的驯化历史
中国枣(Ziziphus jujuba)是最古老的栽培果树之一,拥有7000多年的驯化历史。
它原产于中国,属于罗莎莉斯(Rosales)的鼠李科(Rhamnaceae)。
大枣被视为木本作物和传统草药,仅在中国就种植了200万公顷,年产量约为432万吨。
枣品种传统上被分类为新鲜或干燥,干枣占总产量的约80%。干枣的成熟果实具有粗糙的质地,而新鲜类型的果实具有清脆的质地。
来自西北农林科技大学,新生物生物信息学研究所,康奈尔大学博伊斯汤普森研究所,北京林业大学和昆明植物研究所的国际研究团队对干枣以及31个栽培和野生品种进行了测序,以深入了解其驯化过程。
基因组序列显示栽培的枣植物在其人类培养历史中多次与野生品种杂交。
对基因组的比较分析还发现,一种新鲜食用且质地较为酥脆的大枣(称为冬枣)最近插入其基因组中,这是Junzao品种所没有的。
“比较分析显示,新鲜枣'冬枣'的基因组比'Junzao'大86.5 Mb,部分原因是最近在'冬枣'基因组中插入了转座因子,”作者解释说。
研究人员发现,参与果实糖含量和酸代谢的基因位于品种之间相同的基因组区域,这表明一旦人类鉴定出具有更甜味的枣植物,只有具有这些基因的植物才会被广泛种植。
“在这两个物种之间,很多参与细胞壁代谢的基因发生了变化,”博伊斯汤普森研究所研究员张军飞博士说。
“在干燥和新鲜之间,细胞壁结构完全不同。”
该研究提供了枣在人类培养中如何进化以及驯化在其基因组形成中的作用的见解。
“树木繁殖和驯化比蔬菜更难,因为这是一个漫长的过程,”费博士说。
“从种子到水果的一代人有时需要几年时间。”
这项工作还为致力于创造改良枣品种的育种者提供了宝贵的基因组资源,并且可能适用于其他果树的研究,例如苹果,这些果树正在密集繁殖以生产具有最佳风味的水果。
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