斯坦福大学的研究人员在基因组的黑点中消除了癌症突变
我们的DNA中只有一小部分含有用于制造蛋白质的核苷酸序列。其余大部分用于指定制造蛋白质的方式,时间和地点。这些规则在我们的DNA中被编码为监管元素,它们使得一种细胞类型与另一种细胞类型不同,并使它们在无人看管的教室中像儿童一样狂奔。当事情出错时,后果(如猖獗的增长和癌症)可能会非常严重。
遗传学家迈克尔·斯奈德博士和博士后学者科林梅尔顿博士,从近期组合信息的癌症基因组图谱,国家之力进行排序,并确定在许多不同类型的癌症的基因突变,从全国数据ENCODE项目,其作为DNA功能区或元素的百科全书。他们的目的是更好地了解监管区域突变在癌症发展中可能发挥的作用。
Snyder和Melton发现,每种癌症类型中每千个突变中只有不到一个发生在基因的编码区。相反,超过30%的突变发生在监管区域。该研究于今天上午在Nature Genetics上发表。
斯奈德领导斯坦福大学遗传学系并指导斯坦福大学基因组学和个性化医学中心,他将比较寻找导致致癌突变的只是在编码区寻找“在灯柱下寻找”,以便在晚上丢失钥匙。直到最近,基因的编码区域被研究得最多,并且意外的突变就像拇指一样突出。我们已经知道编码区域之外还有更多的基因组,但在ENCODE项目于2012年基本完成之前,研究人员往往处于黑暗状态,看他们应该在哪里,甚至如何看待。
本研究的研究人员比较了来自436人的八种癌症的基因组序列,重点关注ENCODE定义的调控区域以及它们控制的基因的编码序列。一些调控突变热点已经知道,一些在已知与癌症相关的基因的调控区域中被发现,并且一些似乎控制先前未与癌症相关的基因的表达。然而,在许多情况下,突变似乎影响称为转录因子的蛋白质与DNA结合并触发或抑制附近基因表达的能力。
从长远来看,修改基因规则可能是一种更有效的方法,而不是改变编码序列本身。正如Synder告诉我的那样,“有些基因你可能不会在没有杀死它们制造蛋白质的能力的情况下发生突变。相比之下,调节突变更有可能产生功能性但错误调节的蛋白质。而且癌症都是关于MIS监管“。
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