从内到外研究癌症表观遗传密码可以告诉医生疾病
接受癌症诊断可能会失去对一切的控制。在这种诊断之后,患者,家人和朋友往往渴望获得更多信息。它有侵略性吗?提供什么治疗?这些治疗方法有效吗?会传播吗?有时医生可以提供答案,但在其他情况下,他们是难以捉摸的。如果没有信息,患者可能会决定使用苛刻的药物治疗良性肿瘤或进行危险手术,或者可能采取观察性的方法治疗侵袭性肿瘤 - 这两种方法都不理想。
肿瘤如何相互不同 - 无论是在不同器官中还是在同一器官内 - 都可以提供有关预后和治疗的有用线索。最终,这种知识可能导致精准医学,医生不仅要治疗肿瘤,还要根据患者的特定肿瘤进行治疗。4月17日在线表观遗传学和染色质在线发表的一项大规模的肿瘤新分析,正在使医学更接近这些目标。
像通往罗马的所有道路一样,细胞有很多通路可以变成癌症。其中一条道路涉及细胞如何读取表观遗传密码,即位于人体DNA上的“其他遗传密码”。在每个细胞中,DNA被标记为化学基团 - 如DNA上的标志 - 构成表观遗传密码并充当指南。这些标志有助于细胞机器知道何时激活或灭活基因。在健康细胞中,正确放置这些标记并以正确的比例表达基因。然而,在许多肿瘤细胞中,标记被错误地应用。
当极端数量的健康甲基化学基团(如基因的开/关开关)被错误地添加到细胞DNA上的许多位置时,就会发生一种不正确的DNA标记。因此,这些新添加的甲基不是细胞与其天然生物学工作相结合,而是导致细胞表现不规律,导致细胞表达基因处于错误的水平,或根本不表达。这通常会破坏小区中正常的信息流。重要的是,这些标志可以关闭关键的防御基因,有助于保护细胞免于癌变和破坏其他过程。当发生这种情况时,它被称为“CpG岛甲基化表型”或简称CIMP。
“当化学标志不适当地放在基因上时,细胞就会失去其自然防御能力,从而导致像癌症这样的疾病,”Laura Elnitski博士说,他是转化和功能基因组学分部的高级研究员。国家人类基因组研究所(NHGRI)。“在某种程度上,它就像失去对城市的控制 - 停车灯变得混乱,垃圾收集停止,速度限制在其他问题中被忽略。”
研究人员发现,CIMP肿瘤与不同肿瘤类型的不同结局有关。例如,在乳腺癌中,CIMP与较低的恶性肿瘤风险和较高的存活机会相关。但前列腺癌也是如此,它可以表明更具侵袭性的癌症。因此,患者的状态可以帮助医生更详细地了解特定肿瘤和疾病进展。
为了更好地对肿瘤进行分组,医生需要一种方法来分析CIMP的肿瘤,以找出“阳性”与“阴性”的患者。由Drs领导的团队。Elnitski和FranciscoSánchez-Vega是Elnitski博士实验室的前博士后研究员,他对来自15种不同癌症类型的5,000多种肿瘤样本以及近24种癌细胞系进行了全面的CIMP分析。他们发现CIMP可以在几乎所有类型的癌症的子集中找到,并且表现出与正常样本的极端差异。
从这数千个肿瘤中,可以使用超过8,000个DNA标记来定义肿瘤中的CIMP。从这一点开始,他们将8,000个旗帜放入了一个仅有89个标记的小型,强大的标记中,这些标记可以准确地确定患者在至少12种肿瘤类型中的状态。这些发现应有助于进一步对肿瘤进行分类,为患者和从业者提供有价值的信息。它还可以使诊断和治疗更接近精准医学。
“近年来,CIMP已经在多种器官的肿瘤中进行了研究,所以我们现在知道很多肿瘤都有这种情况。这就是我们所说的”泛癌症“现象,这意味着它是我们在许多类型的癌症,“埃尔尼茨基博士说。“有了这套标记,我们希望了解导致CIMP的原因,在分子水平上找出肿瘤中发生的情况,更重要的是,帮助临床医生指导对患者的护理,使他们不仅得到更好的护理,而且正确的护理。“
为了实现精准医学的承诺 - 通过其有针对性的治疗和治疗 - 医学科学必须能够将疾病分类为更小的亚组。因此,癌症诊断不会简单地告诉患者癌症的类型和位置,还会告诉患者特定癌症的分子和表观遗传特征。有了这些信息,预后和治疗都会变得更加精确。
从长远来看,这项CIMP研究可能有助于其他科学家揭示这一特定癌症相关事件背后的遗传机制。最终,这些机制可能被用作其他疗法的目标。在短期内,该研究为继续研究CIMP提供了坚实的基础,以及一组可用于创建临床试验以确定CIMP肿瘤的标记物。如果测试成功,医生就会对这些癌症有更好的临床表现。这将使他们能够更好地告诉患者担心他们的癌症,提供可能有助于患者感受更多控制的问题的答案。
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