研究人员识别出影响肿瘤基因表达的编码基因之外的数百个突变

科学家首次将位于编码基因之外的突变与肿瘤基因表达的变化联系起来，有助于未来诊断和治疗策略的发展。

癌症由于不受控制的细胞生长和分裂而发展，最终导致癌细胞在全身的转移性扩散，导致大量器官功能障碍。

开创性研究表明，转化为癌细胞是由细胞DNA突变的积累所驱动的。

研究人员已经阐明了基因内特定突变的影响，并发现这些突变在癌症的标志中发挥着不可或缺的作用。这项研究已经导致了当今临床中使用的许多成功治疗方法的发展。

然而，在癌细胞中发现的绝大多数突变都存在于基因之外的DNA序列中，称为非编码区。这些突变对审讯更具抵抗力。

加州大学圣地亚哥分校的研究人员在非编码区域发现了数百个突变，这些突变直接调节了癌症相关基因的表达。他们的工作发表在Nature Genetics期刊上。

“大多数与癌症相关的突变发生在基因组之外的基因组区域，但其中有许多令人难以置信的很多，很难知道哪些实际上是相关的，哪些只是噪音，”资深作者Trey Ideker博士说。摩尔斯癌症中心和加州大学圣地亚哥分校医学院。

使用The Cancer Genome Atlas(TCGA)进行了一些理解非编码突变影响的尝试，这是NIH建立的来自正常组织和肿瘤的基因组测序数据库。然而，这些努力仅确定了一种相关的非编码突变。

在使用TCGA数据的同时，Ideker和他的合作者在其他人无法通过添加额外的分析层的情况下取得了成功。

“秘诀就是寻找基因表达的变化，”Ideker说。

“这是我们第一次发现大约200个在癌症中起作用的非编码DNA突变 - 这比我们之前知道的要多199个，”他补充道。

该团队通过模拟这些功能性非编码突变在癌细胞系中的影响来验证他们的发现。

他们发现这些突变直接影响了驱动癌症标志的基因表达，包括肿瘤细胞侵袭。

“一个突出的例子是影响一种名为DAAM1的基因的非编码突变，”第一作者，在Ideker实验室的博士后研究员Wei Zhang博士说。

“DAAM1激活使肿瘤细胞更具攻击性，并能更好地侵入周围组织。”

他们的工作可能有助于开发新的诊断和治疗策略，依赖于识别患者肿瘤中的功能性突变。

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