研究人员对红狐基因组进行测序
一个国际科学家小组成功地对红狐(Vulpes vulpes)的基因组进行了测序。
家犬和红狐是密切相关的物种,仅在大约1000万年前在犬科中分化。然而,这两个物种占据了截然不同的生态位。
红狐狸的地理范围比食肉目中的任何其他野生物种都要宽,甚至已成为许多主要城市的常见居民。
另一方面,这只狗因为一个不同的原因而变得普遍:它至少在15000年前被灰狼驯化而成为了人类最好的朋友。
“我们一直在等待这个工具很长一段时间,”主要作者,伊利诺伊大学研究员Anna Kukekova博士说。
“在我们之前的工作中,我们试图找出负责驯服和攻击性行为的狐狸基因组区域,但这些研究需要参考基因组,我们可以使用的只是狗基因组。对我们来说,狐狸基因组为行为的遗传分析提供了更好的资源。“
在对狐狸基因组进行测序和组装后,Kukekova博士及其同事对来自驯服,侵略性和传统农场种群的一组狐狸进行了测序,以确定与对行为选择的反应相关的基因组区域。
他们解码了每个群体中10个个体的基因组,然后将它们与完整的狐狸基因组相互比较。
这三个种群在103个基因组区域存在差异,其中一些区域对驯服和攻击性行为负有责任。
“通过我们以前的工具,以这样的分辨率找到基因组区域是出乎意料的,”Kukekova博士说。
“现在,我们第一次不仅可以确定染色体的一部分,这使得狐狸更加驯服或具有侵略性,但我们可以找出对其负责的特定基因。”
研究人员将103个基因组区域与其他测序哺乳动物区域进行了比较,发现了一些令人信服的相似之处。
例如,他们确定了狐狸行为区域与狗驯化中重要区域之间的匹配,以及与人类中Williams-Beuren综合征相关的区域,这是一种以非常外向,友好行为为特征的遗传性疾病。
“奇怪的是,我们发现了威廉姆斯 - 比伦地区的侵略性狐狸,而不是驯服的狐狸。我们认为这是相反的,“库克科娃博士说。
“这一神秘发现强调了在充分理解这些地区之前还需要进行多少研究。”
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