科学家对入侵甘蔗蟾蜍的基因组进行测序
一个国际科学家小组对甘蔗蟾蜍(Rhinella marina)的基因组草图进行了测序和分析,这是一种原产于中美洲和南美洲的有毒两栖动物,已遍布全球许多地区。该研究结果显示在该杂志GigaScience。
甘蔗蟾蜍因其对入侵地区的本地动物群的快速适应和有害影响而闻名。然而,尽管具有标志性的地位,但对甘蔗蟾蜍遗传学的理解存在重大差距。
基因组的可用性将有助于缩小这些差距并加速甘蔗蟾蜍的研究。
“尽管它具有标志性的地位,但我们对甘蔗蟾蜍遗传学的理解存在很大差距,到目前为止,还没有人将基因组整合在一起,”研究资深作者,研究所的生物技术和生物分子科学学院的Peter White教授说。新南威尔士大学。
“测序和组装基因组是一个复杂的过程,”第一作者Rich Edwards博士说,他也来自新南威尔士大学生物技术与生物分子科学学院。
“通过使用最先进的测序技术和专业知识,我们对360亿个碱基对进行了测序,并组装了迄今为止最优质的两栖类基因组之一。”
“我们设法使用能够对非常长的DNA进行测序的技术破译了超过90%的甘蔗蟾蜍基因,这使得将基因组拼图更容易组装起来。”
现在可以以更低的成本对更多的蟾蜍进行测序,并且基因组是免费提供的 - 任何人都可以现在访问它并进行进一步的研究。
“对基因组的未来分析将提供对甘蔗蟾蜍进化的见解,并丰富我们对它们与生态系统相互作用的理解 - 它将帮助我们了解蟾蜍如何传播,毒素如何起作用,并提供新的途径来试图控制它人口,“ 来自悉尼大学的共同作者Rick Shine教授说。
“到目前为止,很少有两栖类基因组进行测序,因此这对两栖动物来说也是一个好消息。拥有参考基因组可以为入侵物种如何进化以适应新环境提供有价值的见解。“
拥有基因组还将帮助研究人员找到控制蟾蜍种群的新选择。
“当前的物理清除措施并没有取得成功,但教导本地物种不吃蟾蜍的新方法 - 称为味觉厌恶 - 给了新的希望,”怀特教授说。
“但是,我们需要更多的方法来控制这种入侵物种。”
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