蜥蜴基因组测序
来自德国和美国的一个国际研究小组对巨型tegu(Salvator merianae)的基因组进行了测序,该巨型tegu(也称为黑色和白色tegu)是一种南美蜥蜴,具有自己的加热系统。
“大多数爬行动物不能像哺乳动物一样控制体温,而必须依靠其环境来达到最佳体温,” 德国马克斯普朗克分子细胞生物学和遗传学研究所的团队负责人Michael Hiller博士说。合着者。
“然而,tegu已向迈向全面温血的方向迈出了一步 - 这只蜥蜴可以将自己的体温升高到高于周围环境10摄氏度。”
“虽然它是南美洲雨林和热带稀树草原的土生土长,但它的魅力本质 - 它甚至可以达到一定程度的房屋训练 - 使它成为极其迷人的宠物,深受爬行动物爱好者的喜爱。”
“不幸的是,国际贸易是物种进入新环境的主要原因之一,在那里它们可能成为本地物种的威胁。”
“考虑到tegu独特的生物学特性及其对环境的潜在危险,这种大型蜥蜴的极高质量基因组序列的可用性是识别和分析这些方面的潜在分子基础的丰富资源。”
为了实现这一目标,Hiller博士及其同事使用最先进的技术来读取tegu的DNA并组装其基因组序列。
在新发布的tegu基因组序列是两个以上的十亿DNA字母,并包含22413个编码基因,其中16,995(76%)有可能有人类的直系同源基因。
“与其他爬行动物类似,tegu基因组的很大一部分由重复序列组成,这些序列在基因组中多次出现,”研究人员说。
“重复是组装基因组时的主要问题,特别是当重复序列长于序列DNA片段的长度时,会导致组装中出现间隙(断裂)。”
“它是迄今为止任何爬行动物基因组中最完整的组装,也将帮助我们研究其他蜥蜴和蛇,”他们总结道。
该结果显示在该杂志GigaScience。
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