新的定位技术展示了RNA如何与基因组中的染色质相互作用
由日本理研综合医学科学中心(IMS)的科学家领导的小组开发了一种新方法RADICL-seq,它使科学家可以更好地了解RNA如何通过染色质与基因组相互作用。有条理。
我们对RNA在生物学中的功能的理解发生了许多变化。几十年前,人们普遍认为RNA只是将DNA转换成蛋白质的中介。但是,在2000年代初期对人类基因组的解码导致人们认识到,大量的RNA(在当时被称为“垃圾”)并未编码蛋白质。随后对诸如ENCODE和RIKEN领导的FANTOM等大型基因组计划的研究发现,哺乳动物基因组中存在大量与DNA相互作用的长的非蛋白质编码RNA。这些RNA中的许多都在细胞核中发现,并附着在染色质上。,用于紧密折叠DNA的结构。但是,尚不清楚究竟是什么RNA与不同细胞中 DNA的哪个区域相互作用。
为了更好地理解这些相互作用,并确定RNA是否实际上是染色质结构的一部分,科学家们开发了一种新技术,称为“连接基因和序列的RNA和DNA相互作用复合物”(RADICL-seq),可绘制基因组图谱。完整核中的全RNA染色质相互作用。这项技术发表在《自然通讯》上,允许研究人员识别不同类别的转录本以及细胞类型特异性RNA染色质相互作用的不同基因组占用模式,并强调转录在染色质结构建立中的作用。
为了测试该方法的有效性,科学家们研究了两种非编码RNA,已知它们在某些细胞类型中优先表达。第一个在NEAT1已知,可能与该结构有关,因为它与在哺乳动物细胞核中发现的称为副斑点的神秘结构有关。第二种是Fgfr2,涉及胚胎发育和组织修复,尤其是骨骼和血管的修复。他们发现在小鼠胚胎干细胞中NEAT1是一种早期类型的细胞,几乎只作用于19号染色体的基因组区域,而它本身是从该染色体衍生而来的;而在少突胶质祖细胞中,后者是一种可以分化为脑细胞的发育类型的细胞,它与广泛的细胞相互作用。其他染色体上的基因组区域范围也是如此。相比之下,Fgfr2主要与自身染色体上的基因组区域相互作用。
其中一位学者亚历山德罗·博内蒂(Alessandro Bonetti)说:“这项研究是了解RNA与染色质之间相互作用如何确保适当的基因组功能的第一步。我们的数据表明,RNA可能对基因调控和染色质组织产生更大的影响。”该研究的作者。
“这项技术在基因组范围内的广泛应用将帮助我们理解非编码RNA作为基因组活性调节剂的基本作用,这可能会导致未来的应用和治疗。”研究。
推荐内容
-
满足屠杀病毒的细胞中的小机器
当病毒感染人体细胞时,这些细胞面临着一个难题。他们如何在不伤害自己的情况下销毁病毒呢?犹他州立大学健康科学家通过可视化一个小型细胞
-
科学家公布了创造合成人类基因组的计划
一群由美国主导的科学家和企业家宣布启动一项为期10年的项目,该项目旨在创造合成的人类基因组,此举可能会彻底改变生物技术领域,但会...
-
科学家们阐明了将蛋白质分子插入线粒体外层的机制
弗莱堡大学的研究人员成功地描述了如何将所谓的β-桶蛋白插入线粒体膜中。蛋白质使线粒体能够输入和输出分子。有了这一发现,由Nils W
-
高分辨率成像揭示了隐藏在我们内耳中的进化历史
根据一项新的研究,内耳的骨腔形状提供了人类从非洲分散后所遵循的路径图。通过将骨骼数据与遗传分析相结合,研究人员可以对我们物种的...
-
用于消除活猪病毒的基因编辑
eGenesis是一家致力于将异种移植转变为救生医疗程序的生物技术公司,宣布在电子杂志科学家及其合作者的科学杂志上发表一项研究,证明PERV的
-
蛋白质复合物的结构暗示其在染色体分离中的功能
怀特黑德研究所的研究人员揭示了一种蛋白质复合物的结构,该蛋白质复合物在机器中起着基础作用,在细胞分裂过程中指导染色体分离。在染...
-
一项研究将淀粉酶基因与肥胖联系起来
一个国际研究小组已经将拷贝数变异(CNV)与染色体的结构变异联系起来,这种结构变异导致染色体的一个或多个区域减少或重复,导致肥胖。由伦
-
植物根感觉土壤水和分支朝向它
在实验室中种植的大多数植物都是在凝胶状培养基上培养,而不是土壤。虽然营养丰富,但这种均质培养基通常是土壤的不良替代品,水分和养...
-
影响孩子心理发展的因素之一“夫妻关系”
一个16岁小女孩,特别叛逆,她经常和她的妈妈吵架,每次吵完架她都会跑出去,她甚至想要自杀。这样叛逆的孩子每个大人都会觉得头疼,那...
-
研究人员在模型合成细胞中构建DNA复制
代尔夫特理工大学的研究人员与马德里自治大学的同事合作,创造了一种人工DNA蓝图,用于在细胞样结构中复制DNA。创建这样一个复杂的生物模块