资源可用性推动生活在体内的微生物的人与人之间的差异
在人体中发现的微生物物种的收集因人而异,PLOS计算生物学中发表的新研究表明,这种变异的重要部分可以通过微生物可用的共享资源的可变性来解释。
每个人都拥有数千种不同种类的微生物,即微生物群。生态过程,如资源竞争,有助于确定每个人独特的物种集合。在这项新研究中,巴黎高等师范学院的Charles Fisher及其同事研究了人体内资源的可用性如何影响微生物群。
科学家们开发了一个数学模型,描述了不同微生物物种的丰度与他们使用的资源的可用性之间的关系。该模型基于生态观念,即依赖相同资源的两个物种的种群趋于一致地生长和下降。
研究人员使用该模型以及新的统计分析方法来重新分析来自人类微生物组计划的数据,该项目使用来自数百人的数据来识别生活在人体不同部位或其中的微生物物种。该分析证实,不同身体部位可用资源的变化可以解释这些地点不同物种的相对丰度。
分析还显示人类之间的结果相似。在单个身体部位内,共享资源可用性的人与人之间的差异可以解释人们之间不同微生物种类丰富度的变化。
此外,分析表明,共享共同资源的物种往往在分类学上密切相关。虽然大多数先前对人类微生物群的研究都集中在微生物物种之间的直接相互作用,但这些新发现表明两个物种的相对丰度之间的相关性取决于它们的相关程度。
本研究的重点是健康人类的微生物群,但未来的研究可以探讨资源可用性在疾病中的作用。“我们在本文中开发的方法将使科学家能够研究共享资源在与微生物群相关的疾病中的作用,例如克罗恩病,”Fisher说。“可能有人可以利用这些结果来制定治疗失调症的策略。”
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