埃及果蝠基因组提供了关于蝙蝠在不生病的情况下捕获和传播致命病原体的能力的线索
波士顿大学研究人员,微生物学教授Thomas Kepler;Stephanie Pavlovich,医学博士/博士生;和ElkeMühlberger,国家新兴传染病实验室(NEIDL)生物分子生产核心主任;与美国陆军传染病医学研究所(USAMRIID)和疾病控制与预防中心(CDC)病毒特殊病原体分会合作,今天发布了关于蝙蝠捕获和传播致命病原体能力的新研究,如马尔堡病毒,没有生病。
该研究由国防威胁减少机构资助,研究了埃及果蝠Rousettus aegyptiacus的基因组,并发现了与哺乳动物免疫系统相关的基因家族。具体而言,研究人员发现大量干扰素和自然杀伤基因家族与其他哺乳动物的基因相比显着不同。该研究结果在线发表,并于2018年5月出版的Cell杂志上发表,最终可能会更深入地了解病毒传播,并为受感染的人提供更好的治疗方法。
“我们从蝙蝠身上学到的东西可以帮助我们开发药物,”Thomas Kepler说。“更重要的是,它可以帮助我们理解人畜共患传播 - 动物如何在没有症状的情况下携带病毒,并将其传递给人类。这种传播究竟发生了什么?动物通过长期携带病毒获得了什么?时间,与病毒共同作用,以便在转移时,它在溢出宿主中具有高毒性?“
现在已知蝙蝠携带几种致命的病原体,包括马尔堡和类似SARS的冠状病毒,并通过咬伤或接触唾液,粪便或尿液传播疾病。
Jonathan Towner, a scientist with the CDC's Viral Special Pathogens Branch, decided to investigate a colony of Egyptian fruit bats implicated in a Marburg fatality in Uganda. Towner traveled to Uganda, captured uninfected bats and brought them back to the CDC. There, scientists extracted DNA from a single bat, and sent it to colleagues at USAMRIID for initial sequencing. The USAMRIID scientists sent their data to Stephanie Pavlovich, student in Thomas Kepler's lab at Boston University.
Pavlovich花了两年时间与USAMRIID的同事Sean Lovett一起组装基因组。然后他们将他们的埃及果蝠基因组与其他哺乳动物的基因组进行了比较,其中包括少数其他蝙蝠,人类和豚鼠。他们首先看起来很广泛,然后专注于已知与哺乳动物免疫系统相关的区域。
鉴于这种蝙蝠的进化历史,“我们一直在寻找比预期更大或更小的基因家族,”Cell论文的第一作者帕夫洛维奇说。他们还寻找具有“阳性选择”证据的基因,这一进化过程推动了整个人群中新的,有用的遗传变异。“这使得我们能够找到一些在这种蝙蝠中以更快的速度进化的基因,然后还有一些比我们预期的要大得多的基因家族。”
接近“大于预期”列表顶部的两个基因家族是1型干扰素基因,它们通常被称为“防御病毒的第一道防线”,并且与马尔堡和埃博拉病毒等病毒过程有牵连,自然杀伤细胞或“NK”细胞受体。自然杀伤细胞是人体免疫系统的关键部分,能够快速识别并响应病毒感染的细胞。
帕夫洛维奇说,在埃及果蝠中找到它们是一个惊喜。“人们之前曾看过许多蝙蝠基因组,但未能找到任何传统的NK细胞受体,”她说。“所以,当我们看到这些基因时,事实证明,实际上,是的,蝙蝠确实有NK细胞受体,而且它是一个特殊的不寻常的群体。”这促使Pavlovich重新审视先前测序的蝙蝠基因组,并且使用不同的工具,她也能够在那里找到自然杀伤细胞受体。
开普勒指出,这些初步结果表明他可以称之为蝙蝠免疫系统的“软保护”。“在蝙蝠中激活和抑制的混合比在大多数其他生物中更多,”他说,关于NK细胞受体。“蝙蝠可能会在很短的时间内缓解病毒,试图在不进行全面攻击的情况下防止病毒的增长。这里有一些非常有趣的东西。”
帕夫洛维奇和开普勒指出,这些发现虽然引人入胜,但却是更好地了解蝙蝠对致命病毒的特殊免疫力的第一步。“下一步是弄清楚:'这些额外的基因实际上做了什么吗?'”Pavlovich问道,他现在正在ElkeMühlberger实验室进行细胞系的后续工作。“我想知道拥有这么多人是否有优势,或者他们是否恰好在那里。”
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