一种新的筛选方法可以检测直接的生物分子相互作用
蛋白质是细胞的基本组成部分。它们完成大部分工作,对细胞和身体组织和器官的结构,功能和动态调节至关重要。蛋白质很少单独起作用,它们相互作用,形成蛋白质复合物或结合DNA和RNA来控制细胞的作用。这些复合物是细胞内许多重要反应的关键部分,如能量代谢或基因调控。这些相互作用的任何变化(例如可能由突变引起)都可以使健康和疾病之间产生差异。因此,为了理解细胞如何运作,或在细胞中可能出现什么问题,了解它们的构建块如何相互作用是至关重要的。
新技术使科学家在过去几十年中了解了生物体所具有的遗传信息,这些信息中的哪些信息被积极使用,哪些蛋白质是由细胞在不同情况下制造的。现在,了解蛋白质和RNA信使分子等生物分子如何结合形成功能细胞所需的复合物是一项巨大的挑战。换句话说,我们知道细胞构建的成千上万个部分,但我们不知道它们是如何组合在一起的。
在Nature Communications上发表的一篇论文中,基因组调控中心(CRG)的科学家描述了一种名为“rec-YnH”的新方法的开发,该方法旨在了解数百种蛋白质和RNA之间形成的复合物。时间。
该方法的开发由Sebastian Maurer与Luis Serrano实验室合作开发,是第一种允许同时检测大量蛋白质和RNA分子之间相互作用的技术。研究人员强调开发一种广泛适用的可行且经济实惠的方法。
“我们的方法可靠地测量许多蛋白质或许多蛋白质和RNA片段之间的相互作用,而无需昂贵的专用设备,”Sebastian Maurer解释道。“这种方法可以被任何标准的生物医学研究实验室使用,对于研究细胞中的特定过程,以及研究人员必须一次探索数百万种蛋白质相互作用以寻找特定疾病中涉及的复合物,”他总结道。
两个CRG实验室成功地将他们在生物信息学,生物化学和分子生物学方面的专业知识结合起来,以实施和验证该方法。“我们的合作产生了一种经济实惠且可行的方法,可以生成蛋白质 - 蛋白质和蛋白质 -RNA相互作用的高质量图谱”,博士后研究员,该论文的共同第一作者Jae-Seong Yang说。
“蛋白质和RNA之间的相互作用是许多生物过程的关键,包括基因调控,我们的方法是第一个能够同时检测数百种蛋白质和RNA之间相互作用的方法。拥有如此高效的新工具对于回答与许多疾病有关的重要问题,“该研究的共同第一作者和CRG研究员Mireia Garriga说。
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