使用来自一升水的DNA定位濒危鳗鱼
研究人员通过分析来自河水小样本的环境DNA(eDNA),阐明了日本鳗鱼的分布情况。这可以更快,更有效地调查日本鳗鱼种群,并有助于保护这种濒临灭绝的物种。该研究结果发表于2月27日的“ 水生保护:海洋和淡水生态系统”。
鳗鱼是在海洋中产卵并在沿海和河流中长大的洄游鱼类。世界上有16 种已知物种,分布在150个国家。日本鳗(Anguilla japonica)遍布东亚。自古以来它一直是日本生活的重要组成部分:作为食物来源,传统诗歌和艺术的主题,有时甚至作为崇拜的目标。然而,自20世纪70年代以来,鳗鱼捕捞量急剧下降,并在2014年被添加到国际自然保护联盟(IUCN)濒危物种红色名录中。
大多数日本鳗鱼的河流调查都使用电加工。但是,这种方法需要大量的时间和资源,对于广泛分布的物种,它可能无法收集足够的数据。调查通常在白天进行,而夜间鳗鱼则隐藏在植被和泥土中。
快速发展的eDNA技术可以通过提取和分析水中存在的DNA来监测水生生物形态,而无需捕获有机体本身。在这项研究中,该团队调查了eDNA分析是否可用于显示日本鳗鱼的分布。他们从日本10条河流上游和下游的125个位置收集了1升样品,并使用Real-Time PCR系统分析了这些样品中的eDNA。同时,他们在同一地点进行了电抛成调查,并将其与eDNA分析结果进行了比较。
日本鳗eDNA在91.8%的地方被发现,其中鳗鱼已经使用电铸获得确认(61个地点中的56个),并且还在另外35个未发现鳗鱼个体的区域(主要是上游)中检测到eDNA。这表明eDNA分析比常规调查更敏感,可以检测河流中日本鳗的存在。鳗鱼数量和生物量的电子洗涤数据也与eDNA浓度呈正相关,表明eDNA可以帮助我们估算日本鳗鱼的丰度和生物量。
在这项研究中,电泳需要每条河流三个或更多人,并至少需要三天。收集用于eDNA分析的水样只需要两个人,最多花费半天时间,并且在一天半内由一个人完成数据处理。在进行大规模分布调查时,eDNA分析方法在人力和时间资源方面更好。
这种方法可能会在更大范围内对人群进行调查。它是非致命的,非常适合监测濒危物种。该团队目前正在使用eDNA分析来监测日本和海外的鳗鱼:它可以作为广泛分布的物种的国际统一方法。这可能对全世界鳗鱼物种的保护和可持续利用有很大帮助。eDNA分析方法在处理外来鳗鱼物种入侵方面也很有效。20年来,有报道称外国鳗鱼(欧洲鳗鱼和美国鳗鱼)被释放到日本水道。这些物种看起来和日本鳗鱼一样,难以察觉。它们也是长寿的,因此它们可能会长期影响生态系统。通过使用eDNA分析进行广泛的调查,我们可以迅速识别外来鳗鱼种类及其分布。
本研究由研究员Hikaru Itakura(神户大学理学研究科),助理教授Ryoshiro Wakiya(中央大学),助理教授Satoshi Yamamoto(京都大学),副教授Kenzo Kaifu(中央大学),副教授Takuya Sato进行和副教授Toshifumi Minamoto(均来自神户大学)。
Itakura说:“河流中的eDNA浓度受物理性质如水深和电流速度的影响。接下来我们必须通过澄清这些物理特性对eDNA浓度的影响来提高eDNA 分析的准确性。”
eDNA分析方法在处理外来鳗鱼物种入侵方面也很有效。20年来,有报道称外国鳗鱼(欧洲鳗鱼和美国鳗鱼)被释放到日本水道。这些物种看起来和日本鳗鱼一样,难以察觉。它们也是长寿的,因此它们可能会长期影响生态系统。通过使用eDNA分析进行广泛的调查,我们可以迅速识别外来鳗鱼种类及其分布。
本研究由研究员Hikaru Itakura(神户大学理学研究科),助理教授Ryoshiro Wakiya(中央大学),助理教授Satoshi Yamamoto(京都大学),副教授Kenzo Kaifu(中央大学),副教授Takuya Sato进行和副教授Toshifumi Minamoto(均来自神户大学)。
Itakura说:“河流中的eDNA浓度受物理性质如水深和电流速度的影响。接下来我们必须通过澄清这些物理特性对eDNA浓度的影响来提高eDNA 分析的准确性。”
推荐内容
-
研究表明肺炎细菌如何侵入体内
如果你得了肺炎,甚至感染了切口,你的身体现在就是一个战区。当你的免疫系统与入侵的细菌作斗争时,这场战争的结果可能取决于不是基于...
-
古代癌症受害者首先在考古记录中
在苏丹发现了一种有转移性癌症的骨骼,这一观点对癌症是一种现代疾病的观点提出了挑战,并为专家研究疾病的病因和进化开辟了新的视野,...
-
向日葵基因组序列为更具弹性的作物提供路线图
乔治亚大学的研究人员是一个国际团队的一部分,该团队发布了第一个向日葵基因组序这一新资源将有助于使用遗传工具改善作物恢复力和石油...
-
新寄生虫在地中海摧毁了巨型蛤蜊物种
随着效率的提高,一种神秘的寄生虫正在寻找并杀死仅在地中海中发现的巨型蛤蜊。除非科学家能够尽快找到阻止它的方法,否则他们说软体动...
-
疟疾劫持你的基因入侵你的肝脏
在寻找新的抗疟疾武器方面,大多数药物开发都集中在导致这种疾病的寄生虫上。但杜克大学的研究人员正在尝试不同的方法。不是直接针对疟...
-
细胞发现可以帮助研究遗传疾病
大学开展的研究发现了第一个关于细胞器的数据,这个数据在与人类有远亲关系的古老有机体的人体细胞中非常重要。这一发现将使科学家们能...
-
新证据表明未煮熟的鸡中的细菌如何引起GBS
密歇根州立大学的研究小组率先展示了在煮熟的鸡肉中发现的常见细菌是如何引起格林-巴利综合症(GBS)的。这项由联邦政府资助的研究(现已发表
-
研究表明 能量饮料不利于您的心脏和血压
据《美国心脏协会杂志》上的一项新研究,在短时间内喝32盎司(约950毫升)的能量饮料可能会导致血压升高并增加心脏功能异常的风险。能量饮料
-
生物学家追踪有助于培养结核病多重耐药性的基因
科学家对超过6,000种结核分枝杆菌临床分离株进行了基因测序,这是一种致病性结核病(TB),一种通常会攻击肺部的空气传播疾病。在努力确定导
-
CRISPR筛选识别帮助细胞抵抗西尼罗河寨卡病毒的基因
UT西南大学的研究人员今天报告首次使用CRISPR全基因组筛选鉴定一种有助于细胞抵抗黄病毒感染的基因。令人讨厌的一类病原体包括西尼罗河病毒