转录因子如何探索基因组
转录因子(TFs)是调节基因转录的蛋白质,这是制造蛋白质的第一步。TF的工作方式是搜索整个基因组并结合调节基因的特定区域,使它们“开启”或“关闭”。已知TF不仅与特定的DNA序列结合,而且与非特异性DNA结合非特异性结合。这种非特异性结合可以通过允许它们沿着DNA滑动来显着增加TF发现其特定靶位点的能力。然而,我们不了解超过1,500个人类TF的效率如何变化来扫描大量基因组,定位和绑定特定位点。
现在,EPFL生物工程研究所的David Suter实验室已经找到了一种方法来预测不同TF在活细胞中扫描基因组的效率。科学家通过研究它们如何与“有丝分裂”染色体结合来研究小鼠中的501个TF,这种特性与TFs以非特异性方式与DNA结合的能力有关。
利用光漂白实验和单分子成像,科学家们发现细胞核中TF的运动和它们发现结合位点的效率可以通过有丝分裂染色体结合来预测。
通过将这些实验与全基因组中的TF作图相结合,他们发现不同的TF在发现其位点的能力上有三个数量级的变化。因此,具有强的非特异性DNA结合特性的TF与有丝分裂染色体结合,在细胞核中缓慢移动,并且特别有效地发现它们需要结合的特定序列以调节基因表达。
“转录因子在扫描基因组以发现其特异性结合位点的能力方面差异很大,这些差异可以通过简单地观察它们与有丝分裂染色体结合的程度来预测,”David Suter说。“ 即使在低浓度下表达时,搜索基因组中最有效的转录因子也能够推动基因表达模式的广泛变化,因此对细胞命运决策过程尤为重要。”
推荐内容
-
确定了与最大习惯性酒精使用相关的五个新的遗传风险基因
一项全基因组关联研究已经确定了五个新的遗传风险基因座,这些基因座可以传递从父母到儿童使用有害酒精的风险,并确认了一个先前确定的...
-
制造多功能纳米粒子 可以运送可以治疗多发性硬化症
一群国际研究人员创造了生物相容性纳米粒子,可以治疗各种炎症性疾病,如多发性硬化症和阿尔茨海默病。根据PNAS1发表的一项新研究,中性磷
-
新研究强调了施万细胞的重要作用
在讨论神经元细胞发育时,大多数一般生物学课程都将强调髓鞘化对神经冲动传导的重要性。通常,在这些生物学对话中会提到雪旺氏细胞,但...
-
感染控制不佳归咎于丙型肝炎流行
埃及飓风流行的可接受原因受到卡塔尔威尔康奈尔医学院新研究结果的挑战。估计有14 6%的人口感染了这种病毒,而且几十年来,它的传播主要归
-
12月12日西安曲江新区雁塔区今日疫情数据公布 西安已追踪管
12月12日(星期日)下午5点,西安市政府新闻办在市政府新闻发布厅召开西安市新冠肺炎疫情防控工作新闻发布会第25场,邀请西安市卫健委、市疾
-
看到并闻到食物可以使小鼠肝脏消化
美味的东西的视觉或气味通常足以让你垂涎欲滴,但对食物感知的生理反应可能远远超出你的唾液腺。对小鼠的新研究表明,单独食物的视觉和...
-
候鸟用于导航的眼睛局部磁感应
候鸟在他们的眼睛中使用磁罗盘进行导航。所涉及的感觉机制长期以来一直难以捉摸,但现在,研究人员已经准确地揭示了鸟类导航所处的位置...
-
真菌发生性行为可以带来更好的生物燃料生产方式
为了制造可再生的生物燃料,研究人员希望使用能够利用锯末,杂草和其他植物废料中数亿吨纤维素的生物,而不是用粮食作物中的糖制造它们...
-
全球变暖的主要原因之一是大气CO 2水平的增加
全球变暖是对地球和生物的严重威胁。全球变暖的主要原因之一是大气CO 2水平的增加。这种合作的主要来源2是来自化石燃料的在我们的日常生活
-
新的基因工程技术可以帮助设计 研究生物系统
一项新技术将帮助生物学家修补基因,无论目标是将细胞转变为生产药物的小工厂,修改作物以在有限的水中生长,还是研究基因对人类健康的...