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海水的DNA分析仅在一天内检测到百分之80的鱼类

日本的一个研究小组利用一种新技术,通过分析海水中的DNA样本来识别居住在当地的多种鱼类,并证明这种方法比目测观察更准确,更有效。该研究由日本科学技术战略基础研究项目的一部分进行,包括学术研究员山本智(神户大学人类发展与环境研究生院),MASUDA Reiji副教授(京都大学),ARAKI Hitoshi教授(北海道大学),KONDOH Michio教授(龙谷大学),项目助理教授MINAMOTO Toshifumi(神户大学人类发展与环境研究生院)和兼职副教授MIYA Masaki(自然历史博物馆和研究所生态与环境科学系主任) ,千叶)。

海水的DNA分析仅在一天内检测到百分之80的鱼类

直到最近,对鱼类的海洋调查依赖于潜水或捕获根据外观对鱼类进行分类的方法。除了需要大量人力之外,这些方法还依赖于鱼类分类的专业知识。新的解决方案,以调查问题最近引起关注:环境DNA metabarcoding,一个方法可同时检测多个品种。该方法通过收集和分析海水中鱼类释放的DNA(环境DNA或eDNA)来识别鱼类。到目前为止,研究人员只能对这种方法的有效性进行有限的确认,因为它只在区域得到证实数量有限的鱼类。在诸如日本海岸等许多不同鱼类栖息地的地方,使用传统方法收集的数据有限。由于结果无法与以前的数据进行比较,因此eDNA元编码的有效性仍未得到证实。

该研究小组在京都府的Maizuru湾使用了eDNA元编码。在应用这种方法进行一天的实地调查后,他们能够从海水样本中检测到128种鱼类。在140个视觉调查中观察到的超过60%的物种跨越14年,包括在这128个品种中。不包括仅在某些年份迁移到舞鹤湾的鱼类品种,这一比例上升至近80%。他们还检测到无法通过肉眼观察确认的鱼类。研究人员认为,这种方法是他们第一次能够通过肉眼观察发现某些难以识别的鱼类幼虫。

这些研究结果表明,即使在具有许多不同鱼类的区域,eDNA metabarcoding也使研究人员能够在短时间内对多个地区的鱼进行调查。这种方法可用于监测大面积外来物种的入侵,扩大鱼类分布的调查,以及用于难以进入的区域,如深海,地下湖泊,危险污染水域以及禁止采集标本的保护区。

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