菠菜基因组测序
来自康奈尔大学博伊斯汤普森研究所和上海师范大学的国际研究团队为菠菜(Spinacia oleracea)开发了第一个高质量的基因组序列。此外,该团队对120种栽培和野生菠菜植物的转录组(所有RNA)进行了测序。
菠菜是苋科苋科的一年生或二年生植物,由大约180属和2500种组成,包括甜菜和藜麦等重要作物。
它原产于中亚,被认为起源于波斯(伊朗)。
菠菜是一种重要且营养丰富的绿叶蔬菜,富含类胡萝卜素,叶酸,维生素C,钙和铁。
它通常用作沙拉,煮熟的蔬菜或作为新鲜或熟肉和蔬菜菜肴的成分。
菠菜越来越受欢迎,并在60多个国家种植,在过去的四十年中产量增加了近十倍。
自从菠菜首次被驯化以来,园丁和育种者已经改进了许多农学上重要的特性,例如叶子质量和营养,并且随着时间的推移,这些改进重新塑造了菠菜基因组。
反过来,今天的育种者可以使用基因组信息来加速改进,这对于对抗霜霉病等重大疾病尤其重要。
“本研究中开发的菠菜基因组序列和转录组变体提供了大量有价值的信息,可用于培育菠菜,具有更好的抗病性,更高的产量和更好的质量,”首席合着者博士的张君飞博士说。汤普森研究所和上海师范大学。
来自中国菠菜栽培品种Sp75的植物材料用于开发菠菜基因组序列。
“菠菜基因组包含25,495个蛋白质编码基因,具有高度重复性,其中74.4%的含量以转座因子的形式存在,”Fei博士及其合着者说。
通过更好地了解菠菜基因组,他们发现了几种可能对霜霉病病原体产生抗性的基因。
一旦在抗性多种菠菜中鉴定出来,这些基因可以迅速转移到其他可能更有营养的品种,增强其免疫系统以对抗这种疾病,同时仍然保持可销售的特性。
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