人类肠道微生物组参考基因的综合目录
一个小组为大多数肠道微生物建立了一个不到1000万个基因的综合基因目录,提供了最全面的免费数据库,涵盖了世界各地人类肠道微生物组的多样性。
人体肠道微生物群是肠道中的微生物群。新目录包括大多数这些肠道微生物的接近完整的基因组。它应该帮助科学家了解他们在不同人群中的变异,以及他们如何揭示健康和疾病标记。
研究人员 - 包括医学院的Jumana Yousuf Al-Aama,王军和沙特阿拉伯国王阿卜杜勒阿齐兹大学(KAU)科学系的Sherif Edris - 将以前分散的数据与不同的研究结合起来。该研究表明,样本创建了来自三大洲的队列,至少比以前的基因目录大三倍。
研究人员还展示了如何使用目录发现肠道微生物群的特定群体特征。
他们使用他们的目录分析了来自60个中国南方和100个丹麦健康个体的表型匹配组的一组样本,它确实揭示了特定国家的肠道微生物特征,特别是涉及饮食相关过程,如碳水化合物和氨基酸代谢。
该目录还帮助科学家比较和绘制个体特异性基因(发现在不到1%的个体中)和常见基因(发现超过50%)之间的功能差异。
Wang表示,与常见基因相比,个体特异性基因的丰富功能反映了肠道微生物在应对宿主免疫系统,病毒感染和抗生素治疗等各种挑战中的适应能力。
“对肠道宏基因组的理解还处于早期阶段,”王说。“但这是我们第一次在1000个样本水平上研究肠道微生物群中的常见和稀有实体。”
该研究发表在Nature Biotechnology1上,数据库可在此处获取。
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