用于检测肿瘤中不同癌细胞的新计算机模型
一组科学家设计了一种新的基于计算机的统计模型,能够检测肿瘤内癌细胞的亚型。
恶性肿瘤可包含具有不同突变基因组的不同亚型的癌细胞。然而,大多数现有的基于计算机的模型,通常假设肿瘤仅由一种类型的癌细胞构成,未能检测到可能潜在生长甚至逃避化学治疗的其他亚型。
发表在Bioinformatics1上的国际研究小组的新模型现在可以通过研究基因表达来估计和分类个体肿瘤中每种癌细胞亚型的分数。首席研究员帕特里克弗莱厄蒂说:“这种模式可能对医生推荐一种能够针对肿瘤中癌细胞的所有亚型而不仅仅是多数亚型的联合化疗有用。”
被称为Gaussian-Laplace-Dirichlet(GLAD)模型的美国伍斯特理工学院和摩洛哥Al Akhawayn大学的研究人员首先将其用于计算机生成的肿瘤数据,其中两种亚型的癌细胞表达500种基因,模型成功检测到不同的癌细胞亚型。
通过检测组织特异性基因表达,它还能够对来自大鼠的肝,肺和脑组织的混合群体进行分类。当应用于来自包含四种亚型(经典,胸膜,神经和间充质)癌细胞的原发性脑肿瘤的实验数据时,该模型也成功。
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