基因测序揭示了枣椰树的秘密和历史
枣椰树在中东地区提供了数千年的食物,树荫和建筑材料。但与其他主要作物不同,对这种经济上重要的植物的性状或进化知之甚少。
现在,一个科学家小组发现了基因突变导致含糖日期果实的红色或黄色,并将枣椰树与它们的远亲表亲油棕相连,相隔6千万年的进化。
“颜色变异基因......已被绘制在油棕中,因此我们使用候选基因方法,通过在枣椰树中绘制其直系同源物。这告诉我们,两种物种的颜色特征是平行演变的,“纽约大学阿布扎比分校的遗传学家哈立德·哈祖里说。
这一发现是正在进行的100个日期的一部分!纽约大学基因测序项目。由于在阿拉伯联合酋长国,伊拉克,叙利亚,突尼斯,卡塔尔,巴基斯坦和美国的研究人员进行了为期三年的合作,NYUAD的团队分析了来自中东12个国家的62种枣椰树的基因组序列。 ,北非和南亚。
他们的工作发表在Nature Communications上,提供了第一个关于枣椰树的分子变异的综合目录,并确定了超过七百万个基因突变。除了果实颜色外,该团队还发现了可能对果实品质,成熟和抗病性有重要意义的基因。
“我们希望这些基因组技术中的一些能够让人们想到如何在日冕中加速育种过程,这对未来有用,”纽约大学基因组学与系统生物学中心联合主任Michael Purugganan说。谁领导了100个约会!项目。
收益更高
卡塔尔威尔康奈尔医学院的Joel Malek解释说,遗传信息可用于识别能够应对气候变化挑战的日期变种,例如气温升高,供水减少和盐度增加,同时不会影响水果的甜度。“我们需要基因设施,以便能够回答这些问题。62个基因组还不够 - 我们希望扩大到250个。但这是一个很好的开始。“
该团队还对如何利用遗传学来对抗病虫害感兴趣,例如真菌枯萎病,Bayoud病,它可以消灭整个种植园。
“鉴定与抗病性,果实品质,开花时间和糖代谢相关的途径中的突变对于物种的未来育种至关重要,”法国研究开发研究所的独立遗传研究员Frederique Aberlenc说。
阿联酋哈利法基因工程和生物技术中心的遗传学家Ajay Kumar Garg同意该研究为该地区提供了宝贵的见解。“与果实性状或非生物胁迫耐受性相关的新基因的发现将有助于创造出能够满足中东现代栽培需求的设计师枣椰树品种。”
该研究还揭示了枣椰树的历史,其起源仍然模糊不清。尚未发现任何野生祖先,阿拉伯海湾和北非部分地区都喜欢自己的果树。
中东和北非枣椰树之间的遗传差异显示了两种不同的树种。对此有两种可能的解释:在不同时间分别进行驯化,或者在中东首次种植枣树,然后传播到北非,然后与北非的野生动物进行交叉。
Aberlenc说,这项分析证实了之前的研究表明存在两种枣椰树种群。在西方与东方棕榈树之间的研究中揭示的较高的遗传多样性证实了两个驯化事件的假设。
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