卡塔尔的外显子序列 以预测对两种常见血液稀释剂的反应
科学家们利用100 Qataris全外显子组测序的信息,创建了与两种抗凝血剂相关的药物遗传变异的综合图谱。
这项来自德里CSIR基因组学和综合生物学研究所的研究小组将首次尝试预测卡塔尔病人对基于其基因构成的药物的反应。该研究将出现在药物基因组学中。
这项工作属于药物遗传学领域,这是一个相对较新的研究领域,它源于基因组学的进步,研究遗传了代谢途径中的遗传差异,可以影响个体对药物的反应。
在这项研究中,科学家们研究了华法林和氯吡格雷,这是阿拉伯患者中两种最广泛使用的口服抗凝剂。
鉴于这个海湾国家存在的遗传多样性,其人口可以追溯到非洲,波斯南亚或贝都因人的血统,这些药物的给药剂量水平应该有很大差异,以提高疗效和减少副作用。
Vinod Scaria是一位专门研究精密医学的印度研究人员,他的研究团队基于最初由威尔康奈尔医学院的卡塔尔和纽约研究人员收集的外显子组织数据1。他们的研究领域结合了诸如个人的基因构成,环境,年龄,生活方式和饮食以及其他药物等因素,以实现疾病的精确诊断,治疗和管理。
“这些年来,阿拉伯人口缺乏基因数据是一个主要障碍。”
由于大多数药物的药物临床试验和剂量算法主要来自欧洲高加索人群,因此尚未对阿拉伯人群充分研究药物无效或造成伤害的可能性。
在卡塔尔,心血管疾病是导致死亡的首要原因,2012年,世界卫生组织将约400人死于缺血性心脏病 - 华法林和氯吡格雷可以缓解或预防这种疾病。这些药物可以防止凝块形成或帮助它们在血管中分解。它们通常用于心脏或脑血流中断的患者或经过血管成形术的患者。
由于这些药物会增加血栓形成所需的时间,因此可能会出现出血或出血过多。
“华法林是世界各地广泛使用的血液稀释剂,如果你服用不足,那么你的血栓风险就会增加,如果过多则会增加出血风险,这可能危及生命,致命的,“威尔康奈尔医学院遗传医学主席罗纳德·克里斯特说,他提供了Scaria和他的团队独立使用的原始数据集。“因此,正确的剂量是非常重要的。”
Scaria说,多年来,阿拉伯人群缺乏基因数据。“来自卡塔尔外显子组的数据提供了能够分析遗传变异及其频率以创建药物遗传学图谱的能力,”他解释说。
整个外显子组序列的可用性允许CSIR在群体水平上一起研究许多变体。“像Scaria博士这样的研究正是我们研究卡塔尔基因组的原因,”Crystal评论道。
根据共同研究员Ambily Sivadas的说法,细胞色素(CYP)基因是决定药物代谢的基因。
“一小部分卡塔尔人有两个CYP2C9 * 2变异的非功能性拷贝(纯合子),这显着降低了华法林的代谢,并且需要较低剂量的药物,而绝大多数人有CYP4F2的变体,需要更高的剂量,“他解释说。
大约70%的人患有CYP2C9 * 2变异体,而一半患有CYP4F2变体的人患有贝都因人血统。考虑到所研究人群的样本量很少,研究贝都因人卡塔尔人,非洲人和波斯人 - 南亚人后裔的科学家们对这三个不同亚人群之间的显着差异感到惊讶。
他们还发现人群中与变异CYP2C19 * 3相关的氯吡格雷抗性非常低,这表明氯吡格雷在卡塔尔中非常有效。
“基因检测将提供通过调节剂量来避免不良事件的机会,或者在某些情况下,将其与相容的替代药物交换。因此,它可以在个体水平上实现精确度,并为治疗方案带来更好的结果,“Scaria说。
本文的早期版本指出,Vinod Scaria隶属于卡塔尔的威尔康奈尔医学院,这是不正确的。他和他的团队使用了威尔康奈尔医学院研究人员制作的数据集。
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