新技术可以扩展我们对人类肠道微生物群的认识
许多国际研究人员使用文化遗传学来识别新的微生物,包括人体肠道中的大量细菌。
研究人员利用文化学,首次在2012年推出1。该技术的开发是为了解决宏基因组学的缺点,该基因组学研究从天然样品中回收的遗传物质。宏基因组学已经彻底改变了这一研究领域,但其局限性在于无法分配给已知微生物的大量序列的产量。
现在,来自法国,法属波利尼西亚,沙特阿拉伯,塞内加尔和法属圭亚那的Jean-Christophe Lagier和研究人员确定了1,057个原核物种。他们的研究扩展了已知的人类肠道库,共有531种:人类已知的146种细菌,但在肠道中未知,187种细菌和一种以前未在人类中分离过的古菌,以及197种潜在的新物种,占该物种的20%。这项研究2。
人类被大约1014种细菌大量定居,其中大部分位于人体肠道中。以前的研究主要集中在确定人体肠道核心微生物群的组成,并研究其中的改变与各种疾病如溃疡性结肠炎,结肠直肠癌和坏死性小肠结肠炎之间的联系。
为了识别不断增长的人类微生物群落,科学家们利用微生物文化学,其中应用了高通量培养条件,结合基质辅助激光解吸/电离 - 飞行时间质谱(MALDI-TOF)或16S rRNA扩增和测序
“我们为社区提供了一份礼物......不仅可以了解微生物群,还可以了解它们的功能,”AixMarseilleUniversité高级首席研究科学家Didier Raoult说。
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