OGT启动了用于慢性淋巴细胞白血病研究的高质量NGS小组
牛津基因(OGT)技术,Sysmex令人兴奋,集团公司宣布发起的面板SureSeq CLL + CNV -最后一个高质量的公司,siguiente-generación命令(NGS)提供研究慢性淋巴细胞白血病(CLL)。CNV的SureSeq CLL + panel满足了对每个NGS的拷贝数(CNV)变异(包括12个三体和杂合子低(LOH))以及体细胞变异(即使是在较低的等位基因频率上)的安全检测的需求。该面板经过测试,与军火库数据显示出良好的一致性,可以在5-10Mb的低频率、SNVs (MAF)和等位基因indels中发现大小CNVs,从10%下降到1% MAF和LOH。
整个面板覆盖了CLL的所有最新的、基于测试的和基因组畸变基因,并将允许实验室简化实验室工作流程,将多个分析替换为单个分析。
CLL是成人白血病中最常见的类型,与染色体畸变、体细胞变异、大小CNVs(包括三体)有关。这种复杂的遗传异质性,加上缺乏敏感和安全的NGS解决方案,意味着科学家现在需要使用多种方法来构建CLL样本的基因组谱。
传统上与NGS作斗争的一个特别领域是检测CNVs,这可能发生在重要的肿瘤抑制基因中,如TP53。通常需要额外的技术,如原位微阵列杂交、核型或荧光(FISH)来发现这种CNVs和结构异常,如杂合降低(LOH)和三体12。
CNV的SureSeq CLL +小组是与著名的癌症专家合作设计的,如OGT执行市场营销人员Emma Shipstone, VP的亮点:
经验丰富的癌症实验室的投入有助于设计连接的CNV CLL +面板的SureSeq站点。这是一个很好的CNV检测,提供了优秀的数据质量。这种分析现在可以取代历史上对CLL样本进行基因组分析所必需的多次分析。
对于研究人员来说,NGS的单一小组简化了工作流程,并在单一分析中巩固了各种基因组变化的轮廓。安全的数据分析可以使用流行的、易于使用的解释软件OGT进行,这是一个强大的、互补的编程解决方案,可以准确地识别和显示所有变体,包括CNVs。
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