了解甘薯用蛋白质组学方法

甜，淀粉，橙色甘薯是薯条，砂锅和馅饼的美味和营养成分。但是，尽管人类几千年来一直在种植甘薯，但科学家对蛋白质的构成仍然知之甚少。最近在ACS的蛋白质组研究杂志上发表的一项研究中，科学家分析了甘薯叶片和根的蛋白质组，并在此过程中揭示了植物基因组的见解。

甘薯(Ipomoea batatas)是世界上一些地区的主食。它也常用于动物饲料以及工业产品，如生物燃料。它的基因组令人惊讶地复杂 - 编码比人类基因组更多的预测基因 - 它具有复杂的化学成分。

该团队使用两种不同的方法从根和叶样品中提取蛋白质，然后将其切割成多肽。然后用液相色谱和质谱分析样品，研究小组在甘薯叶中鉴定出3,143种独特蛋白，在根中鉴定出2,928种。甘薯的根(我们吃的部分)具有低蛋白质含量，并且叶子具有许多次级代谢物。这使得提取足够量的蛋白质用于分析变得困难。密西西比州立大学的Sorina和George Popescu及其同事希望了解蛋白质组学方法 - 同时分析蛋白质和遗传数据 - 可以帮助他们更好地了解甘薯根和叶的成分。

当他们将蛋白质组学数据与甘薯基因组进行比较时，他们确定了已发表的基因组序列的某些区域，其数据可以为其提供增强的信息。例如，该分析预测了741个新的蛋白质编码区域，这些区域以前不被认为是基因。

该组织表示，该结果可用于帮助进一步表征和生物强化块茎。

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