精制DNA工具跟踪原生和入侵鱼类
科学家现在可以使用悬浮在水中的DNA片段来编目侵入性或本地物种,而不是用网进行水上滚动调用以了解哪些鱼存在于特定的水体中。康奈尔大学,圣母大学和夏威夷太平洋大学的研究发表于7月14日的“生态学与进化方法”。
“我们已经改进了环境DNA(eDNA)工具,因此,如果河流或湖泊已经威胁,濒危或入侵物种,我们就可以确定那里物种的遗传细节,”资深作者David Lodge,Francis J.说。 DiSalvo康奈尔大学阿特金森可持续未来中心主任,生态与进化生物学教授。“利用eDNA,科学家们可以更好地设计管理方案,用于根除入侵物种,或者拯救和恢复濒危物种。”
此外,通过在水中采集DNA片段并使用聚合酶链式反应(PCR)技术,科学家可以像遗传复制机一样制作数十亿份DNA用于研究,无需捕获鱼类即可收集鱼类栖息地数据。
研究从溪流,湖泊或河流中的小水样开始。“鱼有数百万个细胞,当它们游泳时,它们会留下一小块细胞。因此,我们正在使用这些细胞的整个线粒体基因组来追踪鱼类,”康奈尔大学博士后研究员,共同领导Kristy Deiner说。作者在纸上。
生物学家通常认为从水体中提取的鱼类DNA质量差,而且退化程度很高。事实证明,新的研究是第一个显示相反的事实。例如,在溪流中,大量的鱼DNA保持完整。
“我们越来越接近法医科学家每天在犯罪现场所做的事情。他们对任何人是否处于犯罪现场并不感兴趣,他们有兴趣知道哪些人在犯罪现场,”洛奇说。 。
作为一个例子,洛奇说,亚洲鲤鱼长期以来一直是芝加哥运河系统的入侵物种。“我们只能说'是的,这里有亚洲鲤鱼',”他说。“随着这项技术突破,我们越来越接近学习有多少 - 基于个体之间的遗传差异 - 甚至可能来自它们。然后,研究人员可以评估情境危险并问,'我们可以关闭这些入侵鱼的来源?'“
在使用这项技术时,戴纳说:“例如,如果我们足够早地进入入侵,就有可能根除人口并防止入侵继续进行。”
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