新的在线数据库使用分子结构使基因组成为焦点
爱荷华州立大学的研究人员已经建立了一个可访问的在线数据库,只需单击鼠标即可将关键的基因组数据转化为清晰的焦点。
在今天发表在“科学报告”杂志上的一篇文章中,爱荷华州立大学的一个研究小组提出了一个新的数据库,使科学家能够快速获取人类基因组编码的RNA结构信息。网络上的任何人都可以免费访问该数据库,从而使科学家能够比以往更快速,更轻松地研究RNA的功能和结构。Roy J. Carver生物化学,生物物理学和分子生物学系的助理教授Walter Moss说,这将有助于促进人类生物学的基础研究,并为靶向RNA的新医学治疗铺平道路。
RNA是核糖核酸的缩写,是从基因组转录或复制的分子链。RNA可以是信息载体,充当DNA和蛋白质之间的中间体,或作为介导许多关键调节过程的独立功能分子。与DNA不同,RNA可以“折回”自身,形成与蛋白质复杂性相媲美的结构。这种折叠在RNA功能中起着关键作用,因此获得RNA的结构信息可以为我们理解生物体如何发挥作用提供重要的见解,Moss说。
“RNA是理解生物学的基础,而测序技术的进步已导致潜在功能性RNA的列表爆炸式增长,”他说。
例如,虽然人类DNA的35亿碱基对中仅约2%编码蛋白质,但超过70%被转录成RNA。Moss说,了解这个未知RNA的海洋功能是一个关键的科学挑战,新的数据库提供了绘制它的重要工具。
Moss与研究生Ryan Andrews和研究IT总监Levi Baber一起将整个人类基因组分成了超过1.54亿个重叠窗口,并计算了一系列有助于理解RNA折叠的指标。
“世界上的任何人现在都可以通过一次点击检索曾经需要数小时的计算来确定,”安德鲁斯说。
Moss说,RNA疗法是一种新的医学方法,其中RNA用药物而不是蛋白质靶向,显示出巨大的希望,该出版物中详述的结构数据库提供了巨大的潜在治疗线索库。
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