移动遗传因素改变附近基因的功能
RaúlCastanera-Andrés是NUP / UPNA-纳瓦拉公立大学农业食品工程和农村环境部的工程师,他致力于检测担子菌真菌中的移动遗传元件(转座子),这是一种众所周知的真菌,因为他们生产可食用的蘑菇,是木质纤维素废物的活性降解物。
转座子是能够从一个染色体区域“跳跃”到另一个染色体区域并导致基因组永久性变化的DNA片段。在他的研究中,研究人员已经表明,除了在基因组中引起突变和重新排序之外,一些转座子可以关闭其附近基因的功能,从而沉默有关基因的表达并防止编码的蛋白质被编码。合成。
弗朗西斯·克里克(Francis Crick)阐述了着名的分子生物学中心法则,它确定存储在基因中的遗传信息是从DNA转移到RNA(一种非常类似于DNA的分子),后者被用作生产蛋白质的霉菌。“我们已经看到,当转座子插入基因附近时,其RNA的产生可能会改变,因此编码的蛋白质可能会减少甚至完全消除,”RaúlCastanera解释道。此外,通过对转录组(生物体基因组中存在的基因的转录本的全局集合)的比较分析,已经发现该机制仅存在于具有活性细胞因子甲基化机制的物种中。
转座子对基因组的影响
多年来,转座子的重要性被低估了,因为它们不是基因组编码区的一部分。然而,这些元素在真核基因组中非常丰富,因为它们构成人类基因组的约50%和某些植物(例如玉米)的约85%的基因组。
更重要的是,它们的移动性意味着它们是真核生物进化中的必需元素。虽然有时它们可能构成适应性优势,但这些元素导致的突变总体上导致对生物体的负面影响。“在产生蘑菇的真菌的情况下,这些元素的繁殖导致品种的退化,这转化为栽培菌株的缺乏稳定性,其生长的改变和生产的减少。另一方面,担子菌真菌产生了大量具有工业意义的蛋白质,转座子活性可以阻止这些蛋白质的产生,“他指出。
生物信息学工具
在研究了许多物种的基因组后,RaúlCastanera开发了生物信息学工具,使他能够识别数千个转座子插入物并获得70多种担子菌真菌中这些元素存在的详细图谱,其中许多在生物技术和农业中非常重要。食品工业。
从这些图中出现的信息可以用于真菌的分子分型或用于开发允许识别未知基因功能的生物技术工具。
最后,在他的研究期间,他对木质素降解真菌Coniophoraolivácea的基因组和致病性葡萄真菌Elsinoëampelina的基因组进行了注释,其序列由NUP / UPNA的遗传学和微生物学小组协调,作为其一部分。国际“1000真菌基因组计划”。
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