研究发现用于研究的人类细胞系之间存在很大差异
根据Nature在2016年进行的一项调查显示,超过70%的研究人员未能复制另一位科学家的实验。如果科学家无法重现彼此的工作,重要的发现可能永远不会离开实验室并对人类健康产生影响。耶鲁大学研究员Yansheng Liu表示,这种“再现性危机”的一个原因可能在于不同实验室使用的细胞系存在显着差异。
为了探讨这个问题,刘和一个国际科学家团队从全球六个国家的十几个实验室收集了一个名为HeLa细胞的人类癌细胞系样本。HeLa成立于20世纪50年代初,是最古老,最常用的人类细胞系。他们在均匀条件下培养不同的HeLa细胞,并通过使用最先进的蛋白质组学方法和其他大规模分析观察基因表达,生长速率,蛋白质功能和其他因素随时间的变化。此外,研究小组设计了一项实验来研究细胞系对沙门氏菌感染的反应。
研究小组发现不同HeLa细胞系之间和内部存在显着差异,尤其是称为HeLa CCL2和HeLa Kyoto的细胞系。这种变异在基因和蛋白质表达以及细胞对感染的反应中都很明显。在一个特定的菌株中,研究人员观察到早期一代细胞和后三代细胞生长后检测到的基因表达差异高达7%。
这些研究结果强调了研究人员需要采取措施将这种变异对研究结果的影响降至最低。例如,他们建议报告研究中使用的特定HeLa细胞系类型。在其他策略中,Liu及其同事还敦促使用早期细胞系,记录细胞的基本基因组表达,并重复测试不同样本或模型或实验室中的细胞以确保重复性。
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