环状RNA有望成为癌症生物标志物
随着新技术允许研究人员深入研究基因组和外显子组,一类称为环状RNA的新RNA可能起到一个有趣的作用。
密歇根大学罗杰尔癌症中心的研究人员对多种癌症中的环状RNA进行了编目,并进行了初步研究,表明这些稳定的结构可以作为血液或尿液中的癌症生物标志物。
环状RNA是一种非编码RNA,其形成闭合的环状结构而不是线性结构。新的RNA测序方法使这些方法变得清晰,对它们起作用的原因或方式知之甚少。但它们的稳定结构使其成为开发癌症生物标志物的理想候选者。
该研究发表在Cell上,确定了癌症中circRNA的概要,为未来研究创建了一个数据库。
“我对环状RNA作为非侵袭性生物标志物的潜力感到非常兴奋。由于它们的稳定性,我们可能能够在癌症患者的血液或尿液中检测到这些。这可能对癌症的诊断或预后有用,” Arul M. Chinnaiyan,医学博士,博士,密歇根医学中心转化病理学中心主任和SP希克斯病理学教授。
研究人员从超过800个肿瘤样本中发现了circRNA,作为MiONCOSEQ计划的一部分。他们证明了为MiONCOSEQ开发的捕获RNA测序在检测circRNA方面比现有方法更强大。
“捕获方法可能有限,因为它基于我们用于捕获RNA的探针。但整个外显子组捕获方法使其显着。我们以这种方式捕获大量RNA。这就是为什么我们能够提名如此多的circRNAs以前不知道,“Chinnaiyan说。
该技术仅需要少量总RNA即能鉴定circRNA。这意味着它可以在稀释RNA的地方检测到,例如血液或尿液。
此外,该团队还发现了几种在前列腺癌组织中发现的circRNA。通过评估来自前列腺癌细胞的circRNA,他们发现它们比线性RNA更稳定。它们也可以在尿样中检测到。
“我们能够证明这些circRNA存在于尿液中并且可以检测到来自前列腺癌的那些。我们未来的研究将探索这些circRNA作为尿液或血液癌症生物标志物,”Chinnaiyan说。
研究人员将他们的研究结果转变为一个名为MiOncoCirc的数据库,对来自肿瘤样本的报告的circRNA进行编目。该资源可供其他研究人员使用,以帮助开发新的癌症生物标记物。
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