不同的真菌分泌相似的分解酶组
土壤真菌分泌多种酶,这些酶在生物燃料生产和金属污染土壤和水的生物修复中发挥重要作用。最近的一项研究表明,尽管这些酶的氨基酸序列存在物种特异性差异,但不同的真菌物种分泌了丰富的具有相似功能的酶。该研究增强了对真菌在土壤中发生的过程中所起作用的理解。该研究可用于设计真菌酶用于生物燃料生产和生物修复工作。
真菌分泌多种多样的酶,可以分解顽强的植物材料。这些强效酶降解植物细胞壁成分例如纤维素和木质素,导致二氧化碳从含有死植物材料的土壤释放到大气中。因此,真菌酶不仅是气候动力学的关键驱动因素,而且还有望从生物质中经济有效地开发替代运输燃料。此外,可以利用某些真菌物种的锰[Mn(II)] - 氧化能力来去除污染的土壤和水中的有毒金属。然而,很少有研究表征由在环境中常见的各种Mn(II)氧化真菌分泌的酶。最近,一组研究人员使用液相色谱 - 串联质谱(LC-MS / MS),基因组分析和生物信息学分析来表征和比较四种Mn(II)氧化子囊菌属物种分泌的酶。
研究人员在环境分子科学实验室(EMSL),能源部(DOE)科学办公室用户设施中使用线性离子阱四极杆Orbitrap Velos质谱仪进行了基于LC-MS / MS的比较蛋白质组学研究。该分析揭示了真菌分泌丰富但功能相似的酶组,尽管这些酶的氨基酸序列存在物种特异性差异。这些发现增强了对子囊菌属物种在生物地球化学和气候动力学中的作用的理解,并揭示了可用于可再生能源生产或金属污染水的生物修复的木质纤维素降解酶。
这项研究代表了哈佛大学,EMSL,太平洋西北国家实验室,史密森学会,美国能源部联合基因组研究所(JGI),国家科学研究中心和明尼苏达大学阿卜杜勒阿齐兹国王大学Aix-MarseilleUniversit的科学家之间的合作,以及伍兹霍尔海洋研究所。
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