研究人员快速抵抗抗生素耐药性
两种创新技术的结合 - 由东北部的Slava Epstein开发,另一种由Broad研究所的Paul Blainey开发 - 可以加速发现新的抗生素,杀死病原体而不会遇到阻力,并且可以诊断导致疾病的特定病原体,实现快速,有针对性治疗。“ 自然通讯 ”杂志在一篇论文中描述的新系统说明了奥巴马政府最近发布的“抗生素抗性细菌国家行动计划”,该计划要求全国范围内使用DNA测序追踪病原体的抗生素耐药性。
为何选择DNA测序?因为它揭示了病原体的一举一动,无论是冒犯还是防御。
四种化学物质,称为“碱”,构成了从细菌到我们生物的DNA。这些碱基的顺序或序列决定了生物体的遗传继承。总之,有序碱基 - “基因组” - 说明了制造和维持整个生物体的说明。在细菌的情况下,特定序列可能编码杀死其他细菌的天然化合物,或相反地,编码确保其在面对其他细菌的攻击时存活的细菌。杀手化合物可能是新抗生素的候选物,保护剂化合物是细菌抗生素抗性的来源,让临床医生知道哪些药物不会开处方。
该研究团队的新芯片实验室不仅能够以更低的成本在创纪录的时间内筛选出更多的病原体,而且还能够筛选迄今尚无法进行分析的大量病原体。
“该平台解决了基因组整体测序的瓶颈问题,即DNA本身的制备,”生物学杰出教授爱泼斯坦说。“过去,研究人员不得不种植大量细菌,从中提取,纯化,分割,标记和分选大量DNA,这是一个昂贵且耗时的过程。这个新系统减少了所需的DNA量 - 我们可以使用少量细胞 - 甚至10,000就足够了 - 并且可以产生出色的测序分析。“
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