需要的盐来自死海真菌的耐受性教训
尽管它的名字,死海确实支持生命,而不仅仅是帮助游客漂浮在其水域。藻类,细菌和真菌构成了有限数量的物种,可以忍受地球最低点的极端咸味环境。
当盐浓度非常高时,一些生物在咸环境中茁壮成长。其他生物需要盐才能生长。要了解由丝状真菌Eurotium rubrum使用的生存策略,由以色列海法大学的Eviatar Nevo,美国能源部联合基因组研究所(DOE JGI)的Igor Grigoriev和大学的Gerhard Rambold领导的研究小组德国拜罗伊特及其同事研究了它的基因组。他们在2014年5月9日的Nature Communications上发表了他们的研究结果。
研究小组写道:“在沙漠化和盐度增加的世界中,了解细胞和生物体对高盐度的长期适应性非常重要。” “观察到的功能和结构调整为有助于生物在这种极端环境条件下生存的机制提供了新的见解,但也指出了新的目标,如生物技术改善作物耐盐性。”原则上这一发现可能彻底改变全球盐渍农业通过为在作物中适当使用抗盐基因和基因网络奠定必要的理解基础,使它们能够在沙漠和盐水环境中生长。
DOE JGI团队首先对大肠杆菌的2620万个基因组进行了测序,组装和注释。该团队发现基因组中含有超过10,000个预测基因。他们还发现,红色毛癣菌蛋白的天冬氨酸和谷氨酸含量高于预期。当研究小组将E. rubrum的基因家族与其他两种嗜盐物种(Wallemia ichthyophaga和Hortaea werneckii)的基因家族进行比较时,他们发现所有三个物种中都存在高酸性残留物,这是所有耐盐微生物的共同特征。
为了更多地了解真菌对盐的耐受性,海法大学的Tami Kis-Papo在液体和固体培养基中生长样品,盐度为零至死海水的90%。研究人员发现,当它在70%稀释的死海水中生长时,它具有活孢子,这种条件相当于20年前死海中的藻华。由阿尔方斯R. Weig在拜罗伊特大学进行的一项研究E.癣菌转录组,编码RNA分子的小部分基因组,以执行构建和维持细胞的指令,表明在高盐度条件下,真菌细胞需要严格控制细胞膜运输。“这清楚地表明,真菌试图”积极“应对其极端环境并且不会简单地陷入休眠状态,”该团队指出,“正如大幅减少的增长率所预期的那样。”
除了有助于更好地了解农业的耐盐机制外,这项工作还可能适用于DOE在制定改进生物燃料生产的新战略方面的利益。例如,DOE JGI及其合作伙伴正在采购微生物和真菌酶,以便用离子液体进行更有效的生物质预处理,环境友好的有机盐通常用作挥发性有机溶剂的绿色化学替代品。
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