遗传研究人员对罗布斯塔咖啡基因组进行测序
由法国发展研究所的Philippe Lashermes博士领导的一个由科学家组成的大型科学家团队已经生成了罗布斯塔咖啡的高质量草案基因组,科学上称为Coffea canephora(syn.Coffea robusta)。
Coffea canephora- 茜草科的一种开花植物 - 起源于撒哈拉以南非洲中部和西部。
Coffea canephora被认为是两种主要咖啡品种中较小的一种,占世界咖啡产量的约30%,主要用于速溶咖啡和混合咖啡。
与阿拉比卡咖啡相比,它的作物产量更高,含有更多的咖啡因 - 相比阿拉比卡咖啡的1.5%,含有更多的咖啡因。
在他们的研究中,Lashermes博士和他的同事们制作了Coffea canephora的基因组草图,并研究了它与其他植物物种的区别。
“通过查看咖啡基因组和咖啡特有的基因,我们能够得出一些关于咖啡特殊性的结论,”Lashermes博士说,他是“科学”杂志上发表的一篇论文的高级作者。
与包括葡萄和番茄在内的其他几种植物物种相比,Coffea canephora含有较大的基因家族,这些基因与生物碱和类黄酮化合物的产生有关,这些因素有助于咖啡香气和豆类的苦味等品质。它还有更多的N-甲基转移酶,这些酶参与制造咖啡因。
仔细观察后,研究小组发现,Coffea canephora的咖啡因酶与植物中的其他基因密切相关,而不是茶和巧克力中的咖啡因酶。这一发现表明咖啡因生产在咖啡中独立发展。如果这种特性是从共同的祖先遗传下来的,那么物种之间的酶就会更加相似。
“事实证明,在进化时期,咖啡基因组不像其亲属那样重复:番茄和辣椒。相反,它保持了与葡萄类似的结构。因此,当基因组中的所有基因复制时,咖啡基因组的进化多样化可能更多地受到特定基因家族重复的驱动,而不是整体,“共同作者法国国家测序中心的Patrick Wincker博士解释说。
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