Rostyk Kuzyakiv的9月虚拟研讨会采访
数据,如金钱,似乎正在推动世界这些日子。在过去的几十年里,数据生成技术发展得如此之快,以至于它已经创造 - 并且将继续这样做 - 大量的数据,像一个非常大的野生动物,需要被驯服和倾向于。大学的能力中心和核心设施在过去20年中已经萌芽,作为集中所生成数据的一种手段,提供了存储,分析和可视化数据的方法。在各种领域:从物理学和生命科学,到天文学和经济学。Rostyk Kuzyakiv是苏黎世大学SIB高性能计算中心和核心设施S3IT的数据科学家,并与LarsMalmström博士(S3IT高级数据科学家)一起负责IPortal,
S3IT的冒险始于2014年,其灵感来自于另一个着名的核心设施:Vital-IT。几年后出现了IPortal,当时显然生物医学数据迫切需要自己的设施。“生物医学数据是 - 现在仍然是 - 正在涌入。我们正在处理许多项目,而且难以应对,” Kuzyakiv说。“不仅需要一个专门用于生物医学数据及其分析的地方,而且研究人员可以轻松地参考并回到这个地方变得必要。”为此,Kuzyakiv,Malmström及其团队与参与此类数据及其理解的研究人员进行了交流。 ,掌握数据存储和检索方面的具体需求,分析软件和可视化结果的工具。
“IPortal是一个超级友好的四步系统,” Kuzyakiv继续道。研究人员可以将数据复制并粘贴到系统中。然后要求他们注释他们的数据集。“这是研究人员倾向于回避的部分,” Kuzyakiv感到遗憾。“但这是这个过程的重要组成部分; 它为您提供了轻松识别和检索您的工作的方法,以用于任何未来目的。“ Malmström补充说:” IPortal 的力量源于简约的设计方法。所有基础组件都在商业友好的开源许可证下,大多数组件已经存在了十年或更长时间,这意味着它们既已建立又稳定。“
尽管知识产权还处于初期阶段,但它已经对许多项目至关重要,其中最新项目的结果已于今年6月在EMBO报告中公布。目前,所有用户均位于苏黎世大学。当被问及“局外人”能否从IPortal中受益时,Kuzyakiv回答说这是他们正在努力的事情,这应该发生在2019-2020期间。
Rostyslav Kuzyakiv目前在苏黎世大学的科学服务和支持IT(S3IT)部门担任数据科学家,该部门是SIB的HPC和核心设施。
在2003年在乌克兰获得医学博士学位后,他在担任多伦多大学医学博士之前曾在多伦多东部综合医院担任临床项目经理。回到欧洲后,他成为日内瓦SIB的研究员,同时还担任日内瓦大学医院的临床数据经理。自2014年以来,Kuzyakiv在S3IT监督本地和国际项目,专注于生命科学和医学的数据管理和生物信息学应用。
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