大型综合医院临床数据中心规划与建设
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大型综合医院临床数据中心规划与建设
黄宇飞许健黄黎明杨永福姜梦稚王福李先锋
*通讯作者:上海交通大学医学院附属新华医院信息管理部主任
①上海交通大学医学院附属新华医院信息管理部,200092,上海市杨浦区控江路1665
②上海复高计算机科技有限公司
摘要目的:大型综合医院临床数据中心如何规划和建设。方法:详述医院临床数据中心
建设规划(项目阶段、项目管理)、建设过程(患者主索引、数据集成、临床门户)、关键技
术与挑战(标准、服务器存储、数据质量)。结果:通过医院的临床数据中心建设实践清晰
的认识到大型综合医院临床数据中心建设如何规划、需建设的内容、可能面临的问题。结论:
临床数据中心建设是一个复杂的过程,涉及面非常广,先期要有明确的规划,建设过程中院
方和厂商都需有持续分析、解决困难问题的决心和毅力,建设完成后要有效的利用临床业务
数据为临床诊疗、科研提供支持。
关键词临床数据中心临床数据中心建设临床数据中心规划
1引言
医院信息化过程是一个不断向前推进的过程,新华医院是一家集医教研和管理于一体的
现代化综合性教学医院,经过10多年信息化建设,医院已经建立了较为全面的业务系统,
包含HIS、EMR、LIS、RIS、PACS、体检、手麻、病案翻拍、病案系统等业务系统。各个业
务系统都有大量的历史数据沉淀,有的系统数据已有10多年之久,部分系统在期间还进行
过升级,由于升级前后系统厂商不同,老的系统数据在新的系统中无法访问。由于信息系统
的硬件、软件、数据库之间的互通性受阻,各个业务系统不能有效地实现信息共享和交换。
[1]这种情况下,新华医院于2013年开始建立临床数据中心,将医院各个业务系统中的临床
数据进行整合、集成,基于临床数据中心建设临床门户(患者360视图、科研分析等)应用,
为临床诊疗、科研提供支持和服务。
2建设规划
临床数据中心建设先期需要进行详细的规划。新华医院临床数据中心先期基础建设主要
分为两个阶段,第一个阶段主要是为临床数据中心提供规范化数据来源,构建临床数据中心,
建设包括EMPI(患者主索引)、ESB(企业服务总线)集成引擎等系统,将医院主要业务系
统的数据集成到临床数据中心。第二个阶段主要是基于临床数据中心建立面向用户使用的临
床门户应用,包含患者360视图、专科视图、科研分析综合应用等。
①①①①①②*
图1临床数据中心建设集成架构图
项目实施管理:临床数据中心实施是一个艰巨的工作,在项目实施前期由建设厂商和医
院共同成立了项目实施小组,其中包含医院分管院长、信息中心主/副主任,以保证项目能
稳步推进。数据集成涉及医院各个业务系统,需要各个厂商的配合,医院每个业务系统信息
中心都有相应的负责人,各负责人对于业务系统都非常熟悉,因此在成立项目实施小组中将
涉及业务系统的信息中心负责人都纳入其中,以便后续项目实施过程中能更为方便的跟各个
业务系统厂商沟通。临床门户应用不像业务系统,有比较清晰的业务流程和刚性的需求,所
以在需求调研、分析过程中就需要临床人员能深入的参与进来,通过基础的应用能逐步的启
发和引导用户提出需求。在专科视图应用中医院确认3个重点专科作为专科视图建设重点科
室,医院为保证最终开发出来的应用能符合满足各科室不同的临床诊疗、科研需求,由每个
科室主任指派临床和科研经验丰富的医护人员(信息联络员)全程参与项目建设进程中的调
研、测试、试运行等,临床数据中心先期两个阶段整体规划建设周期为一年。
3建设过程
EMPI(患者主索引):临床活动是以患者为主线的,因此建立统一的患者主索引服务是
数据整合的基础,通过建立患者唯一标识将多个业务系统患者信息有效的关联起来,并以此
为基础实现医疗数据层面的整合,便于临床、教学活动中展现统一、完整、连续的患者诊疗
信息。患者主索引服务实现患者ID注册服务、智能的搜索引擎、患者主索引管理(包括搜
索、合并、拆分、编辑索引等),实现基于患者主索引的门诊患者信息整合、住院患者信息
整合、体检患者信息整合等。
通过患者唯一标识信息(医保卡、身份证)和患者其它信息(例如:性别、出生日期、
联系人、等)等建立患者“精确匹配”、“模糊匹配”两种匹配模式,当患者挂号就
诊过程中,填写、修改患者基本信息后通过患者主索引系统进行患者信息库匹配,满足精确
匹配规则可直接建立患者交叉索引,不满足精确匹配满足模糊匹配的情况下,由人工干匹配。
通过使用精确匹配和模糊匹配两种模式能更好的提高患者匹配率,提高了患者数据的历史完
整性。
数据集成:临床数据集成主要是针对业务系统产生的病人诊疗数据进行整合,根据新华
医院各系统临床数据存储情况,为确保病人诊疗数据的横向完整性,数据集成几乎涵盖了
HIS信息系统、EMR电子病历系统、LIS检验系统、RIS检查系统、PACS影像系统、护理系
统、病理系统、心电系统、手麻系统以及体检系统等所有病人诊疗相关的业务系统数据。临
床数据中心库主要包含结构化数据库、文档库、影像库三类,涵盖结构化数据、非结构化数
据,结构化数据例如:病人基本信息、用药数据、检验报告数据、检查报告数据等,非结构
化数据例如:患者电子病历文档、心电图、PACS影像等。数据中心建设先期从节约能源的
角度考虑,不单独建立影像库,PACS影像还是从原有的PACS系统库中基于DICOM(医学图
像和相关信息的国际标准,ISO12052)标准通讯协议接口进行数据调阅。
临床门户:临床门户是基于临床数据中心建立的用户前台数据访问系统,包含患者360
视图、专科视图、科研综合分析等应用模块。在项目实施过程中,针对临床门户功能应用、
患者数据访问、打印、下载等功能设计了一套精细的权限方案,通过和医务科、护理部、门
办等各个部门沟通协商,针对用户不同的角、不同的组分别设定了不同的功能和数据访问
权限。权限方案别加入了针对不同客户端(通过IP、计算机名确定)的功能应用、数
据访问权限设计,以便在实际使用中满足不同的权限分配机制,增加权限分配的灵活性。为
保证患者数据的安全性和隐私性,针对用户在临床门户中访问的患者数据增加了可追溯机
制,用户访问患者的数据日志在后台都进行了详细的记录,细至哪个用户工号、什么时间点、
什么客户端访问了患者什么数据(基本信息、用药、检验检查报告、病历等)。精细的权限
方案设计即满足了医院要求不同的临床用户对功能、数据访问的权限不同需求也保障了患者
的数据隐私。
(1)患者360视图:基于临床数据中心建立临床门户患者360视图模块,通过患者主索
引将患者历史所有诊疗数据进行串联展现,用户能直观清晰的查看患者历史所有数据。通过
SSO(单点登录)技术将临床门户360应用集成到门诊医生工作站、住院医生工作站、住院
护士工作站等相关系统中,并且与实时就诊患者关联,让医生在诊疗的过程中只点一个按钮
或菜单就能即时访问到该患者的历史诊疗数据,无需重复在临床门户中查找患者。
图2患者360视图
(2)专科视图:在项目建设过程中,针对3个专科提出的需求进行分析,每个专科都做
了不同的功能应用。对于每个专科、每个医生关注患者的疾病、用药、检验指标都不同,针
对这一需求建立专科视图库设置模块,用药、检验等数据可设置个人、专科数据项。其中针
对儿童相关科室做了生长曲线、bmi曲线等应用。
图3患者专科视图
(3)科研分析综合应用:大量的临床数据是科研分析的基础,临床数据中心建立后,基
于临床数据中心根据专科不同需求开发了一系列科研应用,包括科研数据综合检索(将患者
基本信息、诊断信息、检验检查指标、手术信息、医嘱信息、体检信息等结合)、检验用药
对比分析、单病种分析等,通过对大量数据的分析从中发现揭示诊疗规律,评价临床疗效,
从而更加有效地指导临床实践。
4关键技术与挑战
4.1信息标准HL7是标准化的卫生信息传输协议,是医疗领域不同应用之间电子传输的协
[2]议。临床数据中心建设过程中各业务系统数据集成交互严格遵循HL7标准。
4.2服务器存储临床数据中心整个平台建设需要多台服务器支撑,在实际建设过程中部分
对性能要求不是很高的服务安装在虚拟化服务器上,这样既保证性能,又兼顾了成本。在临
床数据中心存储方案设计中要考虑实际需求,充分对各系统相关的临床数据进行统计分析,
计算出历史数据量,分析数据年增长量,从而得出实际的存储需求,根据实际情况制定严谨
的存储方案。临床数据中心建立后,数据安全性和稳定性非常重要,因此存储系统应考虑冗
余配置,减少单点故障。
4.3数据质量问题数据质量问题主要包括数据完整性、数据准确性、各系统数据差异性。
对于患者主索引病人信息越完整匹配率就越高,反之病人信息缺失影响匹配率,单个病人历
史数据纵向完整度降低,医生诊疗无法看到病人完整的历史诊疗数据,科研无法采集病人完
整历史数据。如何提高数据质量可以从两个方面去采取措施,一方面业务系统通过完善程序
增加数据验证和录入规则提高数据完整性和正确性,另一方面数据采集必须标准化,数据清
理要对数据进行有效性检查以纠正误差,存在错误的问题数据要进行说明并记录日志,以便
管理员进行人工检查处理,任何无法纠正的错误要进行注明,通常在后续的应用中这部分数
[4]据将不作为科研分析数据处理。影响数据质量另一关键因素就是基础数据字典建设,基础
数据字典设计要遵循一定的原则,包括数据的唯一性、规范性、稳定性、可扩展性。在临床
数据中心数据集成前期要充分对各业务系统基础数据进行分析,确认基于某一系统数据建立
基础数据字典,包括科室病区信息、员工信息等。各系统数据进入临床数据中心应尽量统一
参照基础数据字典,在实际建设过程中进入临床数据中心各系统字典如无法统一,在临床数
据中心库中要通过编码系统类型加以区分,并且建立字典关联表,保证基础字典的唯一性,
为后续进一步数据挖掘和分析打下坚实基础。
5讨论
临床数据中心建设是一个长期、循序渐进的过程。大型综合医院由于沉淀了多年的临床
业务数据,数据中心建设涉及多个业务系统,所以在建设过程中要充分考虑到横向的广度和
纵向的深度,做好先期规划。如何更好的建设临床数据中心是在项目建设以来各方人员一直
探讨的问题,在建设的过程中我们要有持续分析、解决任何困难问题的决心和毅力,除了技
术问题,资金、管理、其他厂商配合也是影响临床数据中心建设的重要因素。临床数据中心
建设完成后要充分有效的挖掘利用临床业务数据,通过面向用户的临床门户应用更好的为临
床诊疗、科研提供服务。
参考文献
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