布鲁克在Metabolomics 2019上宣布了新的表型组学解决方案
在Metabolomics 2019年,布鲁克重点介绍了创新的质谱(MS)和核磁共振(NMR)系统以及用于分子表型和临床代谢组学研究的新型高价值解决方案。
经过验证的Bruker IVDr NMR解决方案基于全自动化和标准化的600 MHz NMR平台,特别适用于大规模,定量代谢组学和转化表型组学研究。
其标准化和自动化的Bruker IVDr(BI)方法2.0现已在AVANCE®IIIHD以及最新的AVANCE®NEONMR控制台平台上提供。BI 2.0方法通过新的血浆和血清定量包BIQuant-PS 2.0进一步扩展,使用1D NOESY NMR检测和定量多达40种不同的代谢物。BIQuant-PS 2.0提供增强的交互式报告功能和额外的量化质量评估。
新的BI先天性代谢错误(IEM)小组仅供研究使用(RUO)。它是与Metagene财团合作开发的,它可以产生新生儿,儿童和迟发性成人先天性代谢异常的核磁共振代谢结果。这些可以与Metagene的近1000种疾病数据库和儿科转化研究的鉴别诊断进行比较。
医生博士。Metagene的联合创始人,德国海德堡大学儿童医院教授Friedrich Trefz评论道:
通过使用Metagene广泛的数据库支持转化研究,第一次可以自动解释量化结果。这在IEM领域是非常新颖的并且具有很高的价值,因为NMR可以同时检测和量化大量化学上不同的IEM标记,否则需要多种常规分析方法。“
布鲁克还宣布推出用于下一代代谢组学和转化表型组学研究的新型MS解决方案。timsTOF Pro系统采用超高灵敏度4D脂质组学方法,可使用PASEF方法在30分钟内进行深层脂质组分析。
除了从1ul人体血浆中精确定量超过500种脂质并具有高精度和可重复性之外,还可以获得准确的碰撞截面(CCS)以创建4D文库以便于识别。
这种方法可以与在无标记的SpatialOMx™工作流程中在新的timsTOF fleX系统上从MALDI成像获得的组织中的空间分子分布相结合。新的timsTOF fleX通过在单一平台上将高空间分辨率MALDI成像与深度4D LC-TIMS-MS / MS多组学分析相结合,弥合了分子组织成像和体液分析之间的鸿沟。
使用SCiLS Lab 2020和MetaboScape 5.0软件,新的自动化软件工作流程将分子组织图像中的脂质和代谢物注释结合起来。这使得强大,超高灵敏度的timsTOF fleX成为研究组织脂质组学和代谢组学异质性的宝贵研究工具。
一种新的深度发现代谢组学工作流程FIA-CASI-MRMS可用于测定大量未知代谢物的同位素精细结构(IFS)。由布鲁克革命性的scimaX MRMS磁共振质谱仪和MetaboScape 5.0软件提供支持,所选离子(CASI)的连续累积提供了增强的动态范围,大大提高了峰密度和灵敏度。
流动注射分析(FIA)产生具有IFS明确分子式的组合质谱,用于数千种未知代谢物。FIA-CASI-MRMS发现工作流程在注释未知代谢物时提供前所未有的置信水平,从而更深入地进入“暗代谢组”。
结合MRMS的注释能力和核磁共振是尿液代谢物结构阐明的从头策略的基础。Matthew Lewis博士和伦敦帝国理工学院英国国家表现中心的研究小组在分析化学期刊(doi.org/10.1021/acs.analchem.9b00241)中详述了这种新颖的分子谱分析工作流程。
MRMS为NMR分析提供了高可信度的起点,提高了效率并缩短了完整结构解析所需的时间。该工作还详细介绍了一种新型的尿液管道解决方案,该解决方案可促进代谢物的提取,浓缩和纯化。这为长期存储创建了可重复使用的“分数库”,可以在以后进行重新分析。
目前,澳大利亚国家表型中心(ANPC)正在与西澳大利亚州珀斯的布鲁克和默多克大学合作使用类似的分子谱分析工作流程。
对于其大规模的代谢表型分析研究,ANPC在Bruker的IVDr平台上对标准化的NMR进行了标准化,并对影响II QTOF“表型组织的主力”进行了标识,以表征澳大利亚人群中极性和非极性尿代谢物的复杂混合物。
西澳大利亚健康翻译网络旨在通过多个Bruker IVDr NMR和Impact II系统开发世界首屈一指的用于推进精准医学的表型中心,以支持所需的吞吐量增加。
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