暂停阅读交通标志细菌中DNA转录的调节
细胞的生存 - 除了其他重要方面 - 时间问题:歌德大学的科学家和其他大学的同事现在已经确定了这种机制的不同部分,并介绍了该过程的模型。
生物学的核心原则之一是信息从DNA流向RNA,以编码在细胞中起作用的蛋白质。可以说,与遗传密码一样重要的是这种信息流的时机。通过在合适的时间产生正确的RNA和正确的蛋白质,细胞可以有效地制定其生存和成功的策略。一种这样的调节元件,即核糖开关,作为抗生素的潜在靶标引起了人们的兴趣。经过10多年的研究,歌德大学的Harald Schwalbe教授与威斯康星大学的Landick小组,歌德大学生物系的JensWöhnert教授和达姆施塔特工业大学的Süß小组合作,
核糖开关是一小段RNA,可以折叠成不同的结构,这取决于一个小的信使分子是否与它结合。在转录核糖开关中,这些不同的结构表明附近的RNA聚合酶继续产生RNA或停止。在他们最近在ELife上发表的文章中,Schwalbe组及其合作者在合成后释放了xpt-pbuX核糖开关的分子结构,并在小信使分子鸟嘌呤结合后的位置上释放。他们还证明了这种切换到接通位置需要一定的时间。这对该监管程序提出了一定的要求。
由于RNA聚合酶沿着DNA链飞行,产生相应的RNA,它到达xpt-pbuX开关的代码,制造核糖开关,并继续。如果不在鸟嘌呤周围,RNA聚合酶将检测默认的关闭位置并停止合成。然而,如果鸟嘌呤与核糖开关结合,则核糖开关需要重新折叠到位置,RNA聚合酶必须等待足够长的时间才能检测到新的构象。否则,它将始终读为“关闭”,并且永远不会读取该基因。Schwalbe和他的同事发现,这种暂停确实存在,并且它被编码到DNA中。生产xpt-pbuX开关后,RNA聚合酶在DNA代码上遇到这个“暂停站点”并减慢速度,让核糖开关重新折叠适当的时间。
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