活性染色质标记驱动秀丽隐杆线虫细胞核中异染色质的空间隔离
基因表达的发育程序的执行需要将基因组准确地分配到亚核区室中,其中活性常染色质富集中央和沉默的异染色质在核周边1。链接到拉明甲突变退行性疾病的存在表明,核周染色质的结合有助于细胞型完整性2,3。
组蛋白H3(H3K9me)的赖氨酸9的甲基化表征异染色质并介导内核膜4处的转录抑制和染色质锚定。在秀丽隐杆线虫胚胎中,与内核膜结合的染色体结构域蛋白CEC-4通过H3K9me连接异染色质3,5,而在分化的组织,一个第二异-截存途径被诱导。
在这里,我们使用cec-4背景中的RNA干扰筛选,并将MRG-1鉴定为广泛表达的因子,这是肠细胞中第二染色质锚定所必需的。然而,MRG-1仅与常染色质结合,表明它间接起作用。双mrg-1中的异染色质脱离;通过耗尽组蛋白乙酰转移酶CBP-1 / p300或转录因子ATF-8(bZIP家族的成员(已知其募集CBP / p300))来拯救cec-4突变体。
CB-1在cec-4中的过表达突变体足以使异染色质以ATF-8依赖性方式离域。在mrg-1敲低后,异染色质中CBP-1和H3K27ac水平增加,与离域一致。
这表明秀丽隐杆线虫中染色质的空间组织受到沉默染色质的直接核周附着以及常染色质中CBP-1 / p300的活性保留的调节。这两种途径在胚胎和幼虫组织中有差异,MRG-1的CBP-1隔离在分化细胞中起主要作用。
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