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Discovery允许科学家同时对数千个细胞进行索引比现有方法提高了40倍

在典型人体中的37万亿个细胞中,区分一种细胞与另一种细胞的能力并不像你想象的那么简单。OHSU科学家首次开发出一种快速有效识别体内细胞亚型的方法。由Andrew Adey博士实验室的研究人员带领,这一发现将在分子水平上提高对疾病的认识。这项新技术最终可以开发精确的治疗方法,如癌症,破坏大脑神经元的疾病,以及影响心脏和血管的疾病。

Discovery允许科学家同时对数千个细胞进行索引比现有方法提高了40倍

研究结果将于4月9日发表在Nature Biotechnology杂志上。该新技术提供了一种扩大先前已知的用于分析细胞类型的方法的方法,所述细胞类型通过研究其DNA的化学标记的模式来区分。

“在任何存在细胞类型异质性[多样性]的环境中,这将是非常有价值的,”Adey说,他是OHSU医学院分子和医学遗传学助理教授,也是奈特心血管研究所的成员。“感兴趣的主要领域是癌症和神经科学,但我们也将其应用于心血管疾病。”

所有细胞都携带相同的基因组,即细胞内编码的完整基因组。基因在给定细胞中表达的模式是区分神经元与肝细胞的区别。即便如此,事实证明类似细胞之间存在差异。2017年,科学家通过测量它们之间的化学标记 - 与其DNA连接的甲基模式(称为甲基化组),展示了一种辨别神经元亚型的方法。

Adey和共同作者的新研究开发了一种方法,通过向测序仪器读出的每个细胞添加独特的DNA序列组合或指数,一次分析大量单个细胞的甲基化组。科学家们在几种人类细胞系和小鼠大脑中使用了新的索引方法来揭示3,282个单细胞的甲基化组。这与现有的单细胞测序方法相比,吞吐量大约增加了40倍。

“我们可以同时分析数千个细胞,”Adey说。“这项技术将单细胞DNA甲基化文库的制备成本降低到每个细胞50美分,每个细胞从20美元到50美元不等。”

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