真菌在不同时间活跃的'父系'和'母系'DNA
许多类型的蘑菇在它们的细胞中有两个不同的细胞核,一个来自'父亲',另一个来自'母亲'。代尔夫特,乌得勒支和瓦赫宁根大学的研究人员发现来自亲本DNA的基因在不同时间表达“这意味着,当确定参与蘑菇形成的基因时,我们首先需要确定父系或母系核是否活跃,”TU Delft博士候选人Thies Gehrmann说。研究结果发表在PNAS期刊上。于2018年4月11日。
真菌,如蘑菇,在我们的生态系统中发挥着重要作用。在自然界中,它们可以回收死去的植物和动物作为人类,我们不仅吃真菌,还用它们制作食物,如面包和啤酒,以及用作制造药物和其他物质的生物反应器。它们还可以在人类健康中起直接作用,因为它们可以引起感染。为了充分利用蘑菇(和整个真菌)并防止其不良影响,更好地了解真菌是必不可少的。然而,蘑菇是高度复杂的生物,它们的遗传过程也是如此。
在这项研究中,来自TU Delft,Utrecht和Wageningen的研究人员研究了蘑菇中的基因表达,包括模型蘑菇和普通食用菌。他们研究了TU Delft博士候选人Thies Gehrmann发现的非凡现象。“许多真菌在它们的细胞中有两个不同的细胞核,每个都有不同的遗传物质。一个蘑菇从父母那里继承DNA,但这并不像人类那样混合在一个细胞核中。我们现在已经看到两个亲本DNA上的基因在开发过程中的不同时间表达 - 这在以前是未知的。“
这一新发现的影响是,从现在开始,首先需要确定在研究蘑菇时父系或母系核是否活跃,例如在寻求与蘑菇形成有关的基因时。这种新的在蘑菇DNA的分子机制的了解可以用于培育新的菌株,可以提高食用栽培蘑菇,如常见的蘑菇。
PNAS的大部分文章都来自Thies Gehrmann的论文,他获得了博士学位。4月6日星期五在代尔夫特理工大学。“对于我的博士研究,我开发并应用了生物信息学分析方法,以了解蘑菇形成真菌内部和之间的变异。我们现在在PNAS中描述的现象就是一个例子。此外,我还证明了另一个过程被称为选择性剪接,会引起一些变异。这种现象很难在真菌中研究,因此人们普遍认为没有进行剪接。“
成千上万的案例
选择性剪接是细胞中的一个过程,它使单个基因能够产生不同的蛋白质,每个蛋白质都有自己的功能。选择性剪接产物的异常剪接和突变与小鼠和人类的癌症,孤独症和严重的发育障碍有关。尽管对哺乳动物有这些严重后果,但对真菌中可变剪接的研究却很少。Thies Gehrmann现已证明,在真菌S. commune中发生了数千例可变剪接。
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