精确定位导致细菌抗生素抗性的突变
日本的研究人员开发了一种测试细菌对抗生素耐药性的新方法,并在此过程中发现了三种以前未知的抗性突变。他们检测到已知和未知突变的事实表明他们的方法将有助于监测对抗生素的抗性。
抗生素耐药性是一个严重的问题:越来越多的致病微生物对广泛使用的抗生素药物产生免疫力,使它们变得无用。正在做出巨大努力来确定导致细菌对抗生素耐药的机制和突变。了解这一点有助于确保我们能够有效地治疗细菌感染,包括肺炎和感染的伤口,以及不太严重但具有传染性的疾病,如脓疱病和衣原体感染。
来自北海道大学和日本国家先进工业科学技术研究所(AIST)的研究人员开发了一种系统性捕获抗性核糖体RNA(rRNA)基因的方法。rRNA是产生蛋白质的细胞必不可少的部分。它是抗生素的主要目标之一,但rRNA的突变现在是众所周知的抗药性途径。
研究人员在自然或非临床环境中从各种细菌物种中获取rRNA,这些环境一直在发生突变。他们将它们插入缺乏rRNA的无活性大肠杆菌中,发现超过2000个进口的rRNA可以弥补这种缺乏,从而阻止大肠杆菌死亡。然后,他们测试了一种常见的抗生素,壮观霉素,是否有效杀死了细菌,或者rRNA是否给出了大肠杆菌抗性。他们的筛选发现了三种先前未报告的来自抵抗抗生素的病原体的rRNA突变,以及其他已知的突变。尽管之前已经提出使用无活性的大肠杆菌来测试突变,但是该筛选可以分析来自其他病原体的rRNA而不仅仅是大肠杆菌中存在的rRNA。
“我们的研究结果表明,rRNA基因中存在许多不明显和无特征的抗生素耐药点突变,”北海道大学的分子微生物学家Kei Kitahara说。“我们希望我们的方法可用于验证抗生素抗性突变,并有助于开发一个用于发现和诊断耐药细菌的数据库。”
可以使用相同的方法来研究临床样品,例如测试大肠中抗性细菌的粪便样品,以及更广泛的抗生素。
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