大数据有助于发现推动血细胞规格的关键因素
由伯明翰大学的研究人员以及剑桥大学,利兹大学和曼彻斯特大学的研究小组领导的新研究已经确定了通过在培养皿中重现这一过程来推动血细胞发育的关键因素。具有产生血液能力的细胞通常在早期胚胎中在许多发育阶段中被指定,并最终形成血液干细胞,其终生维持并且每天产生数万亿个血细胞。
通过研究六个连续发展阶段并采用计算分析采用“大数据”方法,由生物技术和生物科学研究委员会资助的该联盟研究了数千种基因的行为及其调控因素。
他们的发现发表于发育细胞,发现了之前未知的血细胞发育调节因子,显着进一步提升了我们对这一过程的认识。他们还解释了DNA中的调控元素如何协同工作,推动基因表达以及将一个发育阶段转换为另一个发展阶段。
这些数据还揭示了从不相关的培养细胞类型产生血细胞的最低要求,这种方法对于再生医学产生患者特异性血细胞至关重要。为了接触科学界和感兴趣的公众,小组创建了一个允许无限制数据访问的网站。
该团队认为,提高对驱动血细胞规格的关键基因的了解以及它们如何相互作用将有助于产生干细胞,可用于帮助患有血液疾病的患者,如骨髓性白血病。
来自伯明翰大学的Constanze Bonifer教授解释说:“我们通过收集测量基因活性,染色体结构变化以及调控因子与基因本身相互作用的”多组学“数据,研究了胚胎细胞如何向血细胞发展。以前所未有的细节展示了巨大的相互作用基因网络如何控制血细胞的发育。它还展示了我们如何使用这些数据来增强我们对这一过程的认识“
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