科学家开发出新的分析方法来解码基因组的功能元件

有机体生命中最深刻的变化之一就是安东尼奥·吉拉德斯所说的“胚胎青春期”：早期胚胎停止接受母亲指示如何开发和激活自己的基因组以取代这些指令的阶段。这个关键阶段，称为母系到合子的转变，发生在从海葵到人类的所有胚胎中。然而，它在胚胎中的调控方式还不得而知。

本周在自然方法中，Giraldez及其同事提出了一种新方法来破译胚胎用来指导许多母体信息(mRNA)被破坏的遗传密码，而其他信息则被破坏。Giraldez是耶鲁大学医学院遗传学教授，并且是MBL惠特曼中心的2016年研究奖获得者，他在那里进行了部分研究。

Giraldez说，这种名为RESA(RNA元素选择分析)的方法具有广泛的应用。“这是一种模块化的方法，我们可以在许多情况下使用，取决于研究者想要问的问题，剖析基因组不同部分的含义。它是一个分子'Rosetta石'，帮助我们解码其中的功能元素基因组“。

在这种情况下，他们使用RESA来检测斑马鱼胚胎中数百万个RNA片段的稳定性或衰变，这反过来又提供了关于在母体到合子过渡期间关闭或激活的基因的信息。

Giraldez说，该团队在斑马鱼中开发了RESA，“但目标是将其用于许多不同的物种，因此我们可以在基因组中找到有意义的'单词'或指令，从鱿鱼到小鼠再到人类。” 他计划明年继续在MBL的鱿鱼和其他海洋模型系统中测试RESA，例如海胆和栉水母。

“这是我最兴奋的部分，MBL为我们提供了在多个物种中测试RESA的机会，”Giraldez说。“这是无价之宝;它的作品在世界其他任何地方都无法完成。”

“MBL让我意识到我们对一些物种知之甚多，而对其他物种知之甚少，”Giraldez说。“但是现在，通过像RESA这样的新测序技术，我们可以更全面地了解各种物种的生物学。这真的是一场新的革命。”

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